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[交流]
插入質(zhì)粒啟動子下游的是DNA模板鏈還是編碼鏈？ 已有4人參與
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各位大俠： 小弟菜鳥，被2個問題困得茶飯不思，懇請各位大俠鼎力相助： 1.構(gòu)建質(zhì)粒時，我們通用genebank上查到的mRNA序列插入質(zhì)粒，并置于啟動子下端，進行轉(zhuǎn)錄和翻譯表達。但這2天犯渾了，突然想，質(zhì)粒首先要將插入片段轉(zhuǎn)錄成mRNA（即跟genebank上查到的序列一致的序列），然后以mRNA為模板進行翻譯。但轉(zhuǎn)錄都是以DNA模板鏈轉(zhuǎn)錄成mRNA,所以插入質(zhì)粒的序列應(yīng)該是mRNA互補的那條鏈，即模板鏈，而不是genebank上查到的mRNA序列，但我們通常都是將mRNA序列擴增后插入，并置于啟動子下，這是怎么回事？是不是我以前都做錯了？一下糊涂了。再者，啟動子是與RNA聚合酶結(jié)合的地方，從而啟動轉(zhuǎn)錄，故，啟動子也應(yīng)位于模板鏈而不是位于編碼鏈，可啟動子就是位于編碼基因5端上游，這是為何？徹底糊涂！ 2.表達質(zhì)粒通常都有一個強有力地啟動子并設(shè)計好了各種表達調(diào)控原件，以有利于基因轉(zhuǎn)錄與表達。但外源基因在經(jīng)啟動子啟動轉(zhuǎn)錄成mRNA后，單鏈mRNA是不是就跟質(zhì)粒脫離了，從而在胞質(zhì)內(nèi)進行翻譯，那這樣，質(zhì)粒那些表達調(diào)控原件又如何能調(diào)控mRNA的翻譯表達呢？越想越糊涂，望各位大俠不吝賜教！非常非常感謝大家！ |
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 蟲友問答-分子生物 |
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這個朋友提的問題很有意思，很多人估計從未想過這是個什么問題。 分子生物學上說，轉(zhuǎn)錄的時候，RNA polymerase從promoter啟動，以DNA模板的一條鏈作為模板，合成和模板互補配對的鏈即RNA產(chǎn)物，這條鏈于是叫做模板鏈。但是這個問題似乎沒有什么實際應(yīng)用價值，我們在克隆基因，做體外轉(zhuǎn)錄等等的時候，從genebank拿到一條序列，然后裝上酶切位點，唰唰插到質(zhì)粒的啟動子下游就可以了，轉(zhuǎn)錄出來的自然就是genebank上顯示的那條序列。 直到我遇到一個問題，在做RNA體外轉(zhuǎn)錄的時候，當需要精確計算RNA產(chǎn)物的大小，面對酶切得到的這樣一個模板，產(chǎn)生的RNA是什么呢？ eg： 5’-T7 promoter-XXXXXXXXTCTAGA-3‘ 3‘-T7 promoter-XXXXXXXXAGATCT-5’ 這樣一個產(chǎn)物大家都知道，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物一定是GGG-XXXXXXXXTCTAGA 但是面對酶切產(chǎn)物，模板變成了 5’-T7 promoter-XXXXXXXXT-3‘ 3‘-T7 promoter-XXXXXXXXAGATC-5’ RNA轉(zhuǎn)錄出來，是GGG-XXXXXXXXT？還是GGG-XXXXXXXXTCTAG？ 或者為什么，我們把從genebank上拿來的序列，裝到載體的promoter下方，就一定轉(zhuǎn)錄出來我們插入的序列？ 所以我們裝進入的到底是什么序列？ 這里面應(yīng)該是有一個約定俗成的問題，即，genebank上給出的是mRNA，是翻譯的模板，沒有問題。 但是我們以這條鏈得到的DNA，跟mRNA方向一致的那條鏈并非載體promoter的模板鏈，而是非模板鏈 也就是說，載體上的promoter，是以插入DNA的另一條鏈，也就是跟mRNA互補的那條鏈為模板進行轉(zhuǎn)錄的 所以上面那個不平齊的模板，產(chǎn)生的ＲＮＡ應(yīng)該是GGG-XXXXXXXXTCTAG |
3樓2015-12-10 10:58:19
lifechuteng
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4樓2015-12-10 11:00:35
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5樓2015-12-30 18:47:17
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