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雙酶切很近的酶切位點(diǎn),總是切不成功,如何解決? 已有6人參與
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實(shí)驗(yàn)需要將已有的載體進(jìn)行雙酶切,再插入一段片段。 由于只能插入到多克隆位點(diǎn)上,所以酶切位點(diǎn)的選擇有限,只能選擇靠得很近的兩個酶切位點(diǎn),序列是: GACGTCGGATCCGAATTCGGTACC 需要切的是GACGTC(Aat II)和GGTACC(Kpn I) 之前用的TAKARA的酶,由于Buffer不同,分步酶切,但是效率一直很低,得不到最終的雙酶切。 后來用NEB的酶,使用的是Aat II 和 Kpn I HF快切酶。 然后回收(回收濃度也非常低,0.004~0.015(ug/ul)之間),與目的片段連接。 由于插入片段的目的是為了破壞氨芐的抗性,同時(shí)載體本身具有卡納的抗性。 所以轉(zhuǎn)化之后,先用卡納平板篩選, 挑斑到卡納液體LB中,搖渾后再取部分在amp液體LB中培養(yǎng),想著amp不渾濁的就是插入了片段的。 可是挑了幾十個斑,都是兩種抗性都有,隨機(jī)挑了兩個進(jìn)行測序,發(fā)現(xiàn)目的片段壓根就沒有插入。 中間換了新酶切后的插入片段進(jìn)行連接,仍然沒有成功。 又做了一次雙酶切,回收條帶也非常淺。 是要再多次做一下雙酶切嘛?(因?yàn)榈谝淮斡辛鶄載體同時(shí)做雙酶切,但是又試了兩個進(jìn)行連接,也都沒有連接上) 不知道有什么方法可以更好地進(jìn)行雙酶切? 求大神醍醐灌頂。。。 |
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