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PCR擴(kuò)增結(jié)果有9個(gè)突變位點(diǎn) 已有3人參與
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我用的是地方豬的背最長肌的cDNA為模板,2?Taq MasterMix來擴(kuò)增的CDS區(qū),目的片段1121bp,再連t載體最后菌液pcr后去測序,結(jié)果與ncbi上的原始序列比對(duì)后,發(fā)現(xiàn)了9個(gè)突變位點(diǎn),是不是有點(diǎn)多? @biostar2009 @飛約瘋?cè)嗽?/u> @wizardfan @youlinglyw 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
金蟲 (職業(yè)作家)
金蟲 (職業(yè)作家)
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要看原始測序圖AB1文件,就算他給你判讀為txt文件了,你也要看,假如在兩端有突變是不準(zhǔn)確的,你要重新設(shè)計(jì)引物重新測那一段(末端) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
鐵蟲 (小有名氣)
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1. 用2×Q5PCRmix或者KAPA HIFI PCRmix擴(kuò)下試試,這兩種酶的保真性是taq酶的100倍。 2. 把DNA序列翻譯成氨基酸序列,比對(duì)下氨基酸序列,看看是不是同義突變。 3. 確定地方豬與文獻(xiàn)的來源一樣嗎,會(huì)不會(huì)本來基因就有一定的差異,只不過該基因代表的蛋白功能是相似的。就是蛋白結(jié)構(gòu)域是保守的,功能一樣,基因序列有細(xì)微差別。 |
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