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獨(dú)唱團(tuán)

金蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 14 (小學(xué)生)
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專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] 請教固定吸附位置的優(yōu)化問題

初學(xué)vasp, 想模擬一些前人工作。現(xiàn)在遇到點(diǎn)問題請教一下大家。
我現(xiàn)在想模擬的是小分子的石墨烯吸附。現(xiàn)在遇到問題是不同位置吸附的時(shí)候，坐標(biāo)怎么固定？
這里是石墨烯的一部分，石墨烯所在平面是xy平面

比如說我想做NH3的橋位吸附，那就應(yīng)該把N原子放在5,6 號C原子正中間（當(dāng)然z坐標(biāo)不同）。我現(xiàn)在不知道該怎么固定，我是否需要固定5,6號原子的xy坐標(biāo)呢，如果不固定他們，最后結(jié)果怎么保證N原子就處在橋位上呢？同樣，對于空位也有同樣疑問，麻煩有經(jīng)驗(yàn)的老師同學(xué)指點(diǎn)一下，謝謝。

回復(fù)此樓

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1樓 2012-02-24 19:12:20

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

cavediger

金蟲 (正式寫手)

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liliangfang(金幣+1): 多謝提示 2012-02-25 10:47:41

Selective dynamics
在對應(yīng)坐標(biāo)后面加上F(固定)、T(不固定)

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

我們都老得太快，卻聰明得太遲。當(dāng)我一路跌跌撞撞登上山巔，驀然發(fā)現(xiàn)，本來就有一條筆直的路，直達(dá)山頂....

2樓2012-02-25 10:42:08