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zhoujiang09新蟲 (初入文壇)
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[交流]
熒光定量PCR的實驗思路(求助) 已有1人參與
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| 各位師兄師姐,我想請教一下熒光定量PCR的實驗思路,我之前把RNA提了出來,并逆轉(zhuǎn)錄成cDNA了,并做了普通PCR。現(xiàn)在我要開始做熒光定量PCR了,可是我不怎么會,我做的是相對定量(2-deltadelta Ct 法),請師兄師姐們幫幫我。我聽有些人說先要拿模板(cDNA)上機摸索退火溫度,再拿ct值最小的那個作為標準品,適當?shù)谋稊?shù)稀釋成5個梯度,再做標準曲線,最后上樣品和標準曲線對照,是這樣嗎? |
【分子生物】EPI帖 |
金蟲 (著名寫手)
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你首先得買熒光,不要買多,因為現(xiàn)在你還不知道哪個公司的熒光更適合你的目的基因。具體的結(jié)果還得等你做擴增效率的時候才知道。建議直接做熒光,不做普通的,這樣節(jié)省時間同時也不會比先做普通PCR節(jié)省多少錢。 其次,摸索實驗條件一般都是摸索退火溫度,你可以根據(jù)自己設(shè)計的引物大致確定你的退火溫度在什么范圍,然后做熒光,跑膠,根據(jù)擴增曲線與跑膠條帶灰度值等綜合指標選定一個合適的退火溫度。 再次,合適的Ct值范圍應(yīng)該是18-30,最好在23-24左右。但是有時候15以上,32以下也是可以接受的,這主要和你的目的基因有關(guān)。一般會出現(xiàn)的情況是Ct值太高,但如果你的目的基因拷貝數(shù)太低,那Ct值肯定高。 最后,關(guān)于擴增效率,擴增效率的制作不需要對照,你的目的就是做引物的擴增效率,看這個引物能不能被你所用。目的基因和內(nèi)參都得做,擴增效率直接影響到你的定量計算公式是否適用。只有在擴增效率在90%-105%的時候,才能用你說的那種方法。但有時候120%以下的擴增效率也可以接受。擴增效率的制作是通過倍比稀釋法,做六個梯度。 祝樓主實驗順利 |
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