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shiliu2011木蟲 (正式寫手)
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PCR緩沖液(PCr Buffer) 已有12人參與
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從網(wǎng)上看到的,很不錯(cuò),發(fā)到這里和大家一起學(xué)習(xí)咯!![]() 用于PCR的標(biāo)準(zhǔn)緩沖液見PCR操作范例。于72℃時(shí),反應(yīng)體系的pH值將下降1個(gè)單位,接近于7.2。二價(jià)陽離子的存在至關(guān)重要,影響PCR的特異性和產(chǎn)量。實(shí)驗(yàn)表明,Mg2+優(yōu)于Mn2+,而Ca2+無任何作用。 1.Mg2+濃度Mg2+的最佳濃度為1.5mmol/L(當(dāng)各種dNTP濃度為200mmol/L時(shí)),但并非對任何一種模板與引物的結(jié)合都是最佳的。首次使用靶序列和引物結(jié)合時(shí),都要把Mg2+濃度調(diào)到最佳,其濃度變化范圍為1~10mmol/L。Mg2+過量易生成非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,Mg2+不足易使產(chǎn)量降低。 樣品中存在的較高濃度的螯合劑如EDTA或高濃度帶負(fù)電荷的離子基團(tuán)如磷酸根,會與Mg2+結(jié)合而降低Mg2+有效濃度。因此,用作模板的DNA應(yīng)溶于10mmol/l Tris-HCl(pH7.6)0.1mmol/L EDTA中。 dNTP含有磷酸根,其濃度變化將影響Mg2+的有效濃度。標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系中4×dTNPs的總濃度為0.8mmol/L,低于1.5mmol/L的Mg2+濃度。因此,在高濃度DNA及dNTP條件時(shí),必須相應(yīng)調(diào)整Mg2+的濃度。 2.Tris -HCl緩沖液在PCR中使用10~50mmol/L的Tris –HCl緩沖液,很少使用其他類型的緩沖液。Tris緩沖液是一種雙極化的離子緩沖液,pKa為8.3(20℃),△pKa為0.021/℃。因此,20mmol/l Tris pH8.3(20℃)時(shí),在典型的熱循環(huán)條件下,真正的pH值在7.8~6.8之間。 3.KCl濃度K+濃度在50mmol/L 時(shí)能促進(jìn)引物退火。但現(xiàn)在的研究表明,NaCl濃度在50mmol/L時(shí),KCl濃度高于50mmol/L將會抑制Taq酶的活性,少加或不加KCl對PCR結(jié)果沒有太大影響。 4.明膠明膠和BSA或非離子型去垢劑具有穩(wěn)定酶的作用。一般用量為100μg/ml,但現(xiàn)在的研究表明,加或不加都能得到良好和PCR結(jié)果,影響不大。 5.二甲基亞砜(DMSO) 在使用Klenow片段進(jìn)行PCR時(shí)DMSO是有用的;加入10%DM-SO有利于減少DNA的二級結(jié)構(gòu),使(G+C)%含量高的模板易于完全變性,在反應(yīng)體系中加入DMSO使PCR產(chǎn)物直接測序更易進(jìn)行,但超過10%時(shí)會抑制Taq DNA聚合酶的活性,因此,大多數(shù)并不使用DMSO。 6.甘油:保護(hù)Taq酶,增加酶的穩(wěn)定性,以提高產(chǎn)量 ![]() ![]() 歡迎補(bǔ)充! [ Last edited by shiliu2011 on 2012-6-4 at 19:41 ] |
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