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wuyuan1992金蟲 (正式寫手)
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為什么做PCR時(shí)候模板濃度高了會(huì)擴(kuò)增不出目的片段?
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在做真菌ITS序列擴(kuò)增鑒定種屬的時(shí)候,師兄讓我將總DNA梯度稀釋,分別取原液、稀釋十倍、稀釋一百倍的總DNA作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。因?yàn)閼{師兄的經(jīng)驗(yàn)而談,有時(shí)候可能總DNA濃度太高會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增不出,一次性梯度稀釋擴(kuò)增出目的產(chǎn)物的可能性會(huì)很高。 我想問的問題是: 1、為什么總DNA濃度高作為模板會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增不出東西? 2、PCR時(shí)對(duì)于模板的濃度有什么規(guī)定么? 希望各位蟲友能夠幫忙解答,在此謝過~ |

新蟲 (小有名氣)
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專家經(jīng)驗(yàn): +426 |
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同意樓上提的幾條 我考慮還有其他原因,如下 1 模板濃度過高,在退火時(shí)模板會(huì)和引物競(jìng)爭(zhēng),模板與模板互相結(jié)合 2 在前幾輪PCR反應(yīng)中,引物只是不斷反復(fù)和模板結(jié)合,和產(chǎn)物結(jié)合較少 3 模板濃度過高,最終電泳時(shí)會(huì)有條帶彌散 至于最佳濃度,參考分子克隆實(shí)驗(yàn)指南的說法,用哺乳動(dòng)物基因組DNA做模板時(shí),每個(gè)PCR反應(yīng)所加入DNA約為1 微克,而酵母,細(xì)菌與質(zhì)粒DNA作為模板時(shí),典型模板量應(yīng)為10 ng,1 ng和1 pg |

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