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基因文庫的評價
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各位蟲友:我最近構(gòu)建了一個細菌的基因文庫,所選用的載體是PUC19(載體用BamH酶切),感受態(tài)細胞為DH5α,現(xiàn)在我正在對我的文庫進行評價。 我做了一下幾個方面的工作 1.計算克隆子數(shù),根據(jù)計算公式,大于理論克隆子的數(shù)目。 2.隨機挑取10-20個克隆子,提取其質(zhì)粒,核酸電泳檢測其大小(理論應(yīng)大于空載體)。再對這些質(zhì)粒用BamH酶切,查看酶切后連入載體的基因片段大小是否在理論范圍內(nèi))。 請問:這樣評價文庫,可以嗎?我看了很多人都在考察文庫的滴度,可是我這是一個很小的亞文庫,需要這樣評價嗎? |

新蟲 (正式寫手)
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您好,我想咨詢你一下細菌基因文庫構(gòu)建的問題。 我的是一個革蘭氏陽性菌,基因組經(jīng)Sau 3AI不完全酶切后,與BamHI酶切并CIAP處理后的pUC19連接,然后轉(zhuǎn)化DH5a,但是我的轉(zhuǎn)化涂平板長得克隆很少。pUC19切之后跑膠回收條帶清晰,沒有彌散。感受態(tài)細胞驗證沒有問題,載體自連的話我用了56 ng pUC進行驗證,長了幾十個菌落。那么您認(rèn)為是我的連接有問題還是轉(zhuǎn)化有問題呢? 會不會是連接的量太少?我10ul的連接體系里面有30 ng的載體,150 ng左右的插入片段(2-5kb),16度16 h左右,然后全部涂板,但是只長了幾十個克隆,太郁悶了。 我想問一下,你的連接體系里面,pUC19和插入片段分別加了多少ng?連接了多久呢? |

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