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crazymouse66金蟲 (正式寫手)
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[求助]
土壤總DNA的熒光定量PCR引物
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請(qǐng)問大家，在做土壤總DNA的熒光定量PCR時(shí)，大家用的是16sRNA的哪兩對(duì)引物�。课以诰W(wǎng)上找了一對(duì)926f5’ AAA CTC AAA GGA ATT GAC GG 3'和1100r5’ GGG TTG CGC TCG TTG 3'，不知道這對(duì)行不行呢？還有，在別人的論文看到一對(duì)引物的長(zhǎng)度193bp，但是他是用來做基因擴(kuò)增的，而且這段引物的正向很長(zhǎng)，有57個(gè)堿基，如下圖顯示的。請(qǐng)問這兩對(duì)引物哪一對(duì)比較適合呢？或者說大家還有更適合的嗎？謝謝大家。 截圖00.png |
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木蟲 (著名寫手)
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bacterial Q16S-1 F 5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3' Q16S-1 R 5'-ATTACCGCGGCTGCTGG-3' Reference: Dynamics of bacterial communities during solid-state fermentation using agro-industrial wastes to produce poly-γ-glutamic acid, revealed by real-time PCR and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 我們實(shí)驗(yàn)室用的這個(gè) |
2樓2013-04-10 23:44:14
| 57個(gè)堿基的引物是DGGE用的引物，是含有GC夾子的。不能用于QPCR。你可以將GC夾子序列去掉，就可以使用了。 |
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crazymouse663樓2013-04-11 09:00:35
crazymouse66
金蟲 (正式寫手)
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4樓2013-04-11 20:55:54
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