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浪~頑石
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[求助]
結(jié)構(gòu)優(yōu)化與分子動(dòng)力學(xué)
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| 在MS中，Discover模塊中的結(jié)構(gòu)優(yōu)化與分子動(dòng)力學(xué)之間有什么區(qū)別與聯(lián)系？？？在進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)運(yùn)算之前需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化嗎？？如果需要，為什么？？？？ |
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tylgd2011
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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2樓2013-05-21 17:28:03
fhh2626
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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結(jié)構(gòu)優(yōu)化的作用是為了避免剛開(kāi)始模擬時(shí)由于壞的初始結(jié)構(gòu)（比如兩個(gè)原子過(guò)于靠近，原子鍵長(zhǎng)過(guò)長(zhǎng)，鍵角過(guò)小等）造成的超高勢(shì)能 結(jié)構(gòu)優(yōu)化不是必須的，但是一般情況下在進(jìn)行模擬前都應(yīng)該進(jìn)行以避免出錯(cuò)，不過(guò)以下兩種情況不應(yīng)該使用結(jié)構(gòu)優(yōu)化 1、初始結(jié)構(gòu)有某種物理意義 2、初始結(jié)構(gòu)本身就是某次模擬的最終結(jié)構(gòu) |
3樓2013-05-23 02:03:32
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