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浪~頑石
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[求助]
結(jié)構(gòu)優(yōu)化與分子動力學(xué)
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| 在MS中，Discover模塊中的結(jié)構(gòu)優(yōu)化與分子動力學(xué)之間有什么區(qū)別與聯(lián)系？？？在進(jìn)行分子動力學(xué)運(yùn)算之前需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化嗎？？如果需要，為什么？？？？ |
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fhh2626
木蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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結(jié)構(gòu)優(yōu)化的作用是為了避免剛開始模擬時由于壞的初始結(jié)構(gòu)（比如兩個原子過于靠近，原子鍵長過長，鍵角過小等）造成的超高勢能 結(jié)構(gòu)優(yōu)化不是必須的，但是一般情況下在進(jìn)行模擬前都應(yīng)該進(jìn)行以避免出錯，不過以下兩種情況不應(yīng)該使用結(jié)構(gòu)優(yōu)化 1、初始結(jié)構(gòu)有某種物理意義 2、初始結(jié)構(gòu)本身就是某次模擬的最終結(jié)構(gòu) |
3樓2013-05-23 02:03:32
tylgd2011
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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2樓2013-05-21 17:28:03
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