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08406224新蟲 (小有名氣)
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[交流]
關(guān)于引物設(shè)計(jì)的問(wèn)題 已有4人參與
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| 我在網(wǎng)上搜了下,都是講軟件的使用和引物設(shè)計(jì)的原則的,現(xiàn)在我有些基本的問(wèn)題搞不清楚,想請(qǐng)教下大家。如果知道想擴(kuò)增的序列,還需要找到這段學(xué)列兩邊的序列才能設(shè)計(jì)出引物嗎?如果設(shè)計(jì)未知序列的引物又該怎么辦?我的目的是要設(shè)計(jì)一個(gè)基因的通用引物,具體做法是把這個(gè)基因的所有序列都下載下來(lái),然后做比對(duì),拿保守區(qū)域直接作為引物來(lái)用嗎?本人剛開始做的菜鳥,希望親們能詳細(xì)一些,不勝感激! |
新蟲 (小有名氣)
新蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
| 樓主如果是用未知序列沒(méi)法設(shè)計(jì)引物的,如果你做的材料不知道序列,可以用它的近緣的物種,如單子葉參考水稻,雙子葉參考擬南芥,或者參考模式植物的序列,如水稻,擬南芥,玉米,煙草等,不知道你的通用引物的目的是什么,如果只是擴(kuò)增全長(zhǎng),就不在保守區(qū)域,如果是做表達(dá),那就應(yīng)該也不在保守區(qū)域~應(yīng)該是該基因區(qū)別于其他所有基因的特異序列部分~ |

新蟲 (小有名氣)
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