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菜菜0929木蟲 (小有名氣)
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[求助]
急�。。∵@種基因克隆需不需要用RACE
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| 轉(zhuǎn)錄組測序后篩選出差異基因，克隆這樣的基因需要用RACE技術(shù)嗎？ |
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lxj341401
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送紅花一朵 |
我剛才看了一下，你能不能幫我判斷一下我這樣的流程正不正確？ 第一步，把轉(zhuǎn)錄組測序得到的其中一個差異基因序列輸入OFR finder，的到了一個長的OFR 2.把得到的這個OFR的氨基酸序列放到NCBI Conserved domains檢驗，發(fā)現(xiàn)它屬于一個蛋白家族，這說明我得到的OFR是正確的 第三步，利用這個OFR設(shè)計引物 第四步，從cDNA里用這個引物擴出全長 我這個流程是正確的嗎？還有就是我第一步用來尋找OFR的序列是直接用我測序得到的序列還是用把測序序列比對到NCBI上得到的同源序列？（我之所以有這個疑問是因為老師說考慮到測序得到的序列是contig、unigene拼接出來的，可能不完全準(zhǔn)確） 請幫我回答一下，萬分感謝  |
6樓2013-12-30 10:33:11
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8樓2013-12-30 15:17:11
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