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linglingerl金蟲 (初入文壇)
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[求助]
求分析瓊脂糖凝膠電泳圖 已有4人參與
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求助各位大俠,我剛提取一次質(zhì)粒,跑出來兩條帶,但是最下沿有不甚清晰地一條帶,請問是為什么?如下圖所示: 另外一個比較奇怪的的是,我把質(zhì)粒用一系列濃度的DNase Ⅰ酶切之后跑電泳,上面兩條帶都沒了,只剩下下面的模糊帶,但是為什么會有兩道黑帶呢(如圖2),那又是什么?PS:我用的是6× loading buffer雙染料 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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上面那幅圖是質(zhì)粒條帶,質(zhì)粒分超螺旋、線形和開環(huán)三種形態(tài),電泳顯示大小不一樣,跑出兩三條帶很正常的。下面是沒有完全降解的RNA。 下面那幅圖的亮帶應(yīng)該是降解的DNA(或者混有RNA),兩條黑帶是溴酚藍顯色的結(jié)果,電泳時溴酚藍加多了就是這種樣子。第一個泳道黑帶部分還隱約可見有亮帶,那個應(yīng)該就是質(zhì)粒,其他泳道相同位置應(yīng)該也有帶的,只是量很少,還被溴酚藍遮住了,所以看不到。 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)

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質(zhì)粒有三種構(gòu)型。第一種是共價閉合環(huán)狀DNA(covalently close circular DNA,ccc DNA),它的兩條鏈都保持完整的環(huán)狀結(jié)構(gòu),通常呈超螺旋構(gòu)型。第二種是開環(huán)DNA(open circularDNA,oc DNA),它的雙鏈中的一條保持完整的環(huán)狀結(jié)構(gòu),另一條單鏈上有一到幾個切口。第三種是線狀DNA,這種質(zhì)粒的雙鏈斷裂呈線狀。這三種構(gòu)型的同一種質(zhì)粒在瓊脂糖凝膠中電泳時,出現(xiàn)不同的遷移速率,走得最快的是超螺旋構(gòu)型,其次是線性構(gòu)型,最慢的是開環(huán)構(gòu)型。 一般提質(zhì)粒跑膠,都會出現(xiàn)3條帶,質(zhì)粒圖上2條帶很正常。 |

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