 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1140 | 回復(fù): 3 | ||
| 本帖產(chǎn)生 1 個(gè) 博學(xué)EPI ，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
甜甜的89木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
測(cè)序之后如何構(gòu)建進(jìn)化樹?
|
|
| 測(cè)序完成后,都需要用哪些軟件構(gòu)建進(jìn)化樹,要詳細(xì)過程 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
317求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠(chéng)心求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
324求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
288求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
317求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
287求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085600材料與化工
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 手把手教你用mega構(gòu)建優(yōu)質(zhì)進(jìn)化樹
已經(jīng)有423人回復(fù)
- 利用MEGA5.2對(duì)一株細(xì)菌16SrDNA構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，結(jié)果發(fā)現(xiàn)與BLASTN結(jié)果差的好遠(yuǎn)
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 有關(guān)構(gòu)建細(xì)菌發(fā)育樹的序列問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 急~用MEGA構(gòu)建的進(jìn)化樹上面數(shù)值好多都是0，這個(gè)是什么意思
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 微生物鑒定之后怎么樣建立系統(tǒng)發(fā)育樹
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 測(cè)序結(jié)果很奇怪
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 發(fā)表sci文章 用mega構(gòu)建進(jìn)化樹專業(yè)嗎
已經(jīng)有15人回復(fù)
- mega5.1構(gòu)建進(jìn)化樹(已整合最大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹)
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 急！NCBI的使用和進(jìn)化樹構(gòu)建求助
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 如何用MEGA5.0和Clustalx1.83構(gòu)建進(jìn)化樹
已經(jīng)有386人回復(fù)
- 進(jìn)化樹及序列上傳相關(guān)問題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 構(gòu)建進(jìn)化樹過程中，我如何把我的菌的序列 和我 選擇同源的序列 編輯在一起進(jìn)行比對(duì)？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 關(guān)于系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建方法的求助
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 細(xì)菌多樣性，構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹中如何選擇outgroup？急�。。。。。�！
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 微生物多樣性研究的幾個(gè)問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】進(jìn)化樹的構(gòu)建到底有什么意義呢？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】原創(chuàng)之七：【圖文】系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及編輯【已搜索無重復(fù)】
已經(jīng)有377人回復(fù)
- 【交流】MEGA構(gòu)建進(jìn)化樹史上最難的問題求助，必有金幣酬謝
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】mega建樹方法
已經(jīng)有225人回復(fù)
- 【求助/交流】大家?guī)兔纯次业南到y(tǒng)進(jìn)化樹怎么是這個(gè)樣子的
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助/交流】如何菌類鑒定
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助/交流】做進(jìn)化樹時(shí)如何選擇菌株？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助/交流】系統(tǒng)進(jìn)化樹
已經(jīng)有16人回復(fù)
wolfghost
版主 (知名作家)
- 博學(xué)EPI: 432
- 應(yīng)助: 101 (高中生)
- 貴賓: 7.987
- 金幣: 36642.2
- 散金: 11283
- 紅花: 198
- 沙發(fā): 8
- 帖子: 7788
- 在線: 1298小時(shí)
- 蟲號(hào): 573180
- 注冊(cè): 2008-06-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 電化學(xué)
- 管轄: 有獎(jiǎng)問答
4樓2014-06-05 15:42:45
gufeng2008
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 1116.6
- 紅花: 2
- 帖子: 163
- 在線: 366.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 2815048
- 注冊(cè): 2013-11-20
- 專業(yè): 生物化學(xué)
2樓2014-04-01 09:45:49
煉獄之火
至尊木蟲 (知名作家)
逆水行舟，不進(jìn)則退
- 博學(xué)EPI: 52
- 應(yīng)助: 258 (大學(xué)生)
- 貴賓: 0.228
- 金幣: 13217.6
- 散金: 1402
- 紅花: 44
- 沙發(fā): 4
- 帖子: 6185
- 在線: 787.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 2862838
- 注冊(cè): 2013-12-11
- 專業(yè): 催化化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
甜甜的89: 金幣+50, 博學(xué)EPI+1, ★★★★★最佳答案 2014-06-24 11:44:47
甜甜的89: 金幣+50, 博學(xué)EPI+1, ★★★★★最佳答案 2014-06-24 11:44:47
|
MEGA構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的步驟 MEGA 是一個(gè)非常優(yōu)秀的序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建軟件，使用方便，完全免費(fèi)，可從其網(wǎng)站下載， 最新版本是4.0。下面是用MEGA構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的簡(jiǎn)明操作流程（具體細(xì)節(jié)請(qǐng)參考相關(guān)MEGA教程及使用說明）： 1. 將要用于構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹的所有序列合并到同一個(gè)fasta格式文件，注意：所有序列的方向都要保持一致 ( 5’-3’)。 2. 打開MEGA軟件，選擇”Alignment” – “Alignment Explorer/CLUSTAL”，在對(duì)話框中選擇Retrieve sequences from a file, 然后點(diǎn)OK，找到準(zhǔn)備好的序列文件并打開。 3. 在打開的窗口中選擇”Alignment”-“Align by ClustalX” 進(jìn)行對(duì)齊，對(duì)齊過程需要一段時(shí)間，對(duì)齊完成后，最好將序列兩端切齊，選擇兩端不齊的部分，單擊右鍵，選擇delete即可。 4. 關(guān)閉當(dāng)前窗口，關(guān)閉的時(shí)候會(huì)提示兩次否保存，第一次無所謂，保存不保存都可以，第二次一定要保存，保存的文件格式是.meg。根據(jù)提示輸入Title，然后會(huì)出現(xiàn)一個(gè)對(duì)話框詢問是否是Protein-coding nucleotide sequence data, 根據(jù)情況選擇Yes或No。最后出現(xiàn)一個(gè)對(duì)話框詢問是否打開，選擇Yes。 5. 回到MEGA主窗口，在菜單欄中選擇”Phylogeny”-“Bootstrap Test of Phylogeny” -“Neighbor-joining”，打開一個(gè)窗口，里面有很多參數(shù)可以設(shè)置，如何設(shè)置這些參數(shù)請(qǐng)參考詳細(xì)的MEGA說明書，不會(huì)設(shè)置就暫且使用默認(rèn)值，不要修改，點(diǎn)擊下面的Compute按鈕，系統(tǒng)進(jìn)化樹就畫出來了。 6. 最后，使用TreeExplorer窗口中提供的一些功能可以對(duì)生成的系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)行調(diào)整和美化。另外，還可以用Word進(jìn)一步編輯MEGA構(gòu)建的進(jìn)化樹。 一般說來，MEGA適用于對(duì)少量的序列進(jìn)行比對(duì)和畫Tree，如需處理大量或海量的序列數(shù)據(jù)，建議使用ARB。 如轉(zhuǎn)載，請(qǐng)以超鏈接形式注明：轉(zhuǎn)載自有個(gè)博客 [ https://www.yelinsky.com/blog/ ] 本文鏈接地址：https://www.yelinsky.com/blog/archives/282.html |
3樓2014-04-01 11:23:34
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +7 | 申子申申 2026-03-19 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠(chéng)心求調(diào)劑 +7 | 吃吃吃才有意義 2026-03-19 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)0703化學(xué)318分，有科研經(jīng)歷，求調(diào)劑 +4 | 一瓶苯甲酸 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | eation27 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以） +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國(guó)海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)求調(diào)劑 +3 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +4 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-16 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | ydfyh 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | 小材化本科 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)336分求調(diào)劑 +6 | zbzihdhd 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +4 | 是Lupa啊 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
今年的國(guó)基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢(mèng)微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +4 | 奇點(diǎn)0314 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|