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Red重組PCR相關(guān)問題
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前期通過設計同源臂,以用pkD3中氯霉素片段替換目標基因(電泳結(jié)果、測序結(jié)果均以證明替換成功),導入pcp20質(zhì)粒,通過調(diào)整溫度,以實現(xiàn)氯霉素基因的脫除。平板驗證時菌落在氯霉素板上是無法生長的,初步表明cm基因片段應該已經(jīng)脫除了。但以原來的驗證引物(驗證氯霉素取代了目的基因所設計的引物,在目標基因上下游100 bp左右)進行PCR驗證,換過很多種酶(Takara的ex-Taq,primer star,諾唯贊的mix)并且試過溫度梯度,就是怎么也擴不出來片段。 氯霉素替換目標基因后片段大小在1200bp左右,這個和實驗現(xiàn)象是符合的,后面氯霉素脫除之后,片段大小可能小于500。想請教下各位大俠,之前是否遇到過這種情況,是怎么解決的呢,謝謝! |
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