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關(guān)于蛋白質(zhì)相關(guān)的求教 已有1人參與
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因研究需要，想弄清楚兩種蛋白質(zhì)之間的相互作用關(guān)系，比如發(fā)生了什么樣的相互作用，哪些力的產(chǎn)生使蛋白質(zhì)發(fā)生交聯(lián)，哪些基團(tuán)之間發(fā)生了相互作用，以及通過怎樣的作用而發(fā)生反應(yīng)，由于只學(xué)過簡單的生物化學(xué)，對分子生物學(xué)不是很了解，所以想請教各位蟲友，對于上述問題應(yīng)該如何從實(shí)驗(yàn)的角度表征出來，或者有哪些相關(guān)書籍、期刊、網(wǎng)站等推薦，如果能推薦兩篇相關(guān)的高質(zhì)量綜述類文章那就更好啦，先在這里謝謝各位啦 |
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liuderong
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【答案】應(yīng)助回帖
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如果木南(kx444555代發(fā)): 金幣+10, 鼓勵(lì)交流 2014-09-30 12:34:57
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你問的這些問題都很有挑戰(zhàn)性�。∪绻闶诸^上有一個(gè)好一點(diǎn)的蛋白，那把你問的問題解決了，應(yīng)該可以寫成CNS級別的論文，這時(shí)候就不是我們這種小嘍啰可以在這里討論得明白的了。 要搞清楚兩個(gè)蛋白的相互作用，目前一般是做酵母雙雜交或者pull down實(shí)驗(yàn)。這些方法都只能證明蛋白是否存在互作，至于互作的細(xì)節(jié)那就解釋不了了，但在生物領(lǐng)域，能知道有無相互作用就已經(jīng)是一件了不起的事了。蛋白相互作用的細(xì)節(jié)一般要通過結(jié)晶來闡述，有時(shí)候一些簡單的如磷酸化等可以通過跑膠來判斷。有關(guān)什么相互作用力使得蛋白發(fā)生相互作用這個(gè)問題在生物領(lǐng)域還很少考慮，生物系統(tǒng)過于復(fù)雜，還有未知的東西太多，因而不能像化學(xué)那樣把一個(gè)反應(yīng)放到溶液里去評價(jià)。 相關(guān)基因的相互作用一般是做定量PCR，這是根據(jù)蛋白的功能推測哪些基因會(huì)受影響，然后挑一些基因出來驗(yàn)證。經(jīng)費(fèi)充足一點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)室通常是做表達(dá)譜，或者基因芯片。生物體內(nèi)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)非常復(fù)雜，兩個(gè)看似毫不相關(guān)的基因也有可能通過某種聯(lián)系湊到一起，因而千萬不要將化學(xué)的那一套簡單地移植到生物上來。 相關(guān)文獻(xiàn)很多，我一時(shí)間也不好推薦，畢竟很久沒看了。你到cell、nature或science的主頁搜索一下，一般有關(guān)功能蛋白的研究都會(huì)說到相互作用，目前研究的主流也是這方面的。跟你說兩個(gè)人吧：一個(gè)是鄧興旺，他在植物光信號轉(zhuǎn)錄因子領(lǐng)域可謂是泰斗級別的人，他發(fā)表的有關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的論文同時(shí)涉及蛋白-蛋白和蛋白-基因相互作用；另一個(gè)清華大學(xué)生物院院長施一公，他在結(jié)構(gòu)生物學(xué)上可謂是碩果累累，你可以看看他的介紹為論文。 |
2樓2014-09-30 10:34:07
3樓2014-10-06 19:56:27
liuderong
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好贊好贊~我也是做蛋白互作的，課題很有意思，體外實(shí)驗(yàn)?zāi)茏C明能夠互作，但對體內(nèi)亞細(xì)胞地位發(fā)現(xiàn)兩個(gè)蛋白在完全不同的地方地位，又發(fā)現(xiàn)原來某個(gè)信號能使其中一個(gè)蛋白出核與另一個(gè)蛋白發(fā)生互作。但這又涉及到為什么出核，怎么出核，出核以后的去向，覺得這個(gè)課題確實(shí)很有意思，涉及的面也有點(diǎn)廣，正如你所說，能把其中一個(gè)問題研究清楚也很不容易。我也是植物逆境分子方面的，你說的鄧興旺教授也了解過，也聽過他的幾次報(bào)告，很（￣▽￣）b啊 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
5樓2014-10-07 10:12:50
6樓2014-10-08 08:32:33
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7樓2014-10-08 08:37:16
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