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王憶楠yn新蟲 (小有名氣)
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[求助]
pcr反應(yīng)cytb序列擴(kuò)不出原因?求分析! 已有2人參與
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本人本科生,目前做書虱的種內(nèi)鑒定。之前用引物擴(kuò)增ITS序列,電泳出現(xiàn)條帶,但是送去公司檢測(cè),說亮帶里有比較亂,無法測(cè)序,F(xiàn)在用引物擴(kuò)增cytb序列,發(fā)現(xiàn)沒有條帶。 試劑 ddh2o 31.5ul dNTP 4ul buffer(Mg2+) 5ul 引物1 1.5ul 4個(gè)ep管分裝 每個(gè)ep12.5ul 引物2 1.5ul taq酶 0.5ul 模板 6ul (之前老師也做過幾次,同樣沒有條帶)退火溫度為40.0 41.2 43.9 47.7 52.6 56.5 58.8 60.0“℃。 模板有一年了,但是its 有條帶,很亮,只是無法測(cè)序。用新的模板可以擴(kuò)出很亮的條帶(cytb)。想求助是不是模板的問題. cytb: F TATGTACTACCATGAGGACAAATAT R ATTACACCTCCTAATTATTAGGAAT |
銀蟲 (小有名氣)
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條帶暗有可能是你引物問題,錯(cuò)配率高,由于你用其它模板可以擴(kuò)出目的條帶,證明引物自身沒有問題,只有可能是引物和模板結(jié)合問題,或者是模板本身問題 1.嘗試再一次降低退火溫度,看是否能擴(kuò)出來 2.重新設(shè)計(jì)引物,或者增加引物長(zhǎng)度,提高引物特異性 3.認(rèn)真檢測(cè)一下模板,確定模板沒有問題 |
木蟲 (正式寫手)

新蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)

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