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小小佐羅2木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
微生物454測(cè)序相關(guān)問(wèn)題 已有1人參與
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各位大神，小弟前面做了微生物多樣性的454測(cè)序，投稿了一篇文章，編輯反饋回來(lái)的意見(jiàn)有一句話(huà)看了很久不知道什么意思？請(qǐng)做過(guò)這方面的各位幫忙解釋下， 原句為T(mén)his section is insufficient to assess beta diversity. I suggest the authors use complimentary measures, i.e. OTU vs. Phylogenetic and Presence/Absence vs. Abundance measures (Jacaard, Bray-Curtis, unweighted and weighted UniFrac), to provide a more comprehensive assessment. weigthed and unweighted unifrac 已經(jīng)做了， 關(guān)鍵是 OTU vs. Phylogenetic 這個(gè)應(yīng)該是什么圖 表示什么意思？ 求解答 萬(wàn)分感謝 |
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小小佐羅2
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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3樓2015-06-08 08:10:44
hkqgeoffrey
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2樓2015-06-08 00:46:31
hkqgeoffrey
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【答案】應(yīng)助回帖
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小小佐羅2: 金幣+10, ★有幫助, 想了很久 想明白了 編輯是想讓我從otu的水平上 和物種分類(lèi)水平上都做PCoA圖 看看趨勢(shì)一致不 ， 還有個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教這句話(huà)編輯還加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 請(qǐng)指教 2015-06-10 08:56:15
小小佐羅2: 金幣+10, ★有幫助, 想了很久 想明白了 編輯是想讓我從otu的水平上 和物種分類(lèi)水平上都做PCoA圖 看看趨勢(shì)一致不 ， 還有個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教這句話(huà)編輯還加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 請(qǐng)指教 2015-06-10 08:56:15
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從這段回復(fù)看他是建議你采用兩種結(jié)論能進(jìn)行互補(bǔ)的方法：比如OTU法和進(jìn)化樹(shù)法 或者后面的兩種方法 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
4樓2015-06-08 08:45:40
5樓2015-06-24 14:49:04
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