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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 微生物 » 綜合其他 » 微生物454測序相關問題
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小小佐羅2木蟲 (正式寫手)
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[求助]
微生物454測序相關問題 已有1人參與
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各位大神，小弟前面做了微生物多樣性的454測序，投稿了一篇文章，編輯反饋回來的意見有一句話看了很久不知道什么意思？請做過這方面的各位幫忙解釋下， 原句為This section is insufficient to assess beta diversity. I suggest the authors use complimentary measures, i.e. OTU vs. Phylogenetic and Presence/Absence vs. Abundance measures (Jacaard, Bray-Curtis, unweighted and weighted UniFrac), to provide a more comprehensive assessment. weigthed and unweighted unifrac 已經(jīng)做了， 關鍵是 OTU vs. Phylogenetic 這個應該是什么圖 表示什么意思？ 求解答 萬分感謝 |
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hkqgeoffrey
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小小佐羅2: 金幣+10, ★有幫助, 想了很久 想明白了 編輯是想讓我從otu的水平上 和物種分類水平上都做PCoA圖 看看趨勢一致不 ， 還有個問題請教這句話編輯還加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 請指教 2015-06-10 08:56:15
小小佐羅2: 金幣+10, ★有幫助, 想了很久 想明白了 編輯是想讓我從otu的水平上 和物種分類水平上都做PCoA圖 看看趨勢一致不 ， 還有個問題請教這句話編輯還加了一句Statistical significance could be assessed using "Adonis" in the R package "vegan"，想了半天也不甚明白 請指教 2015-06-10 08:56:15
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從這段回復看他是建議你采用兩種結(jié)論能進行互補的方法：比如OTU法和進化樹法 或者后面的兩種方法 [ 發(fā)自手機版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
4樓2015-06-08 08:45:40
hkqgeoffrey
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2樓2015-06-08 00:46:31
小小佐羅2
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3樓2015-06-08 08:10:44
5樓2015-06-24 14:49:04
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