 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 7 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2190 | 回復(fù): 6 | ||
[求助]
用gromacs軟件做逐漸升溫的時候出現(xiàn)這個問題，求如何解決 已有1人參與
|
|
這是我的md.mdp文件的一部分。 Tcoupl = berendsen tau_t = 0.1 0.1 tc_grps = 14A sol ref_t = 300 300 annealing = single annealing_npoints = 4 annealing_time = 0 5 10 30 annealing_temp = 293 373 373 277 錯誤提示是： Program grompp_mpi, VERSION 4.0.4 Source code file: readir.c, line: 1508 Fatal error: Not enough annealing values: 1 (for 2 groups) |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境總分308求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
306求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料學(xué)學(xué)碩080502 337求調(diào)劑-一志愿華中科技大學(xué)
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
313求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
南昌大學(xué)材料專碩311分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
316求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
346求調(diào)劑[0856]
已經(jīng)有7人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- gromacs中的mdp文件的編譯問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 關(guān)于MS和GROMACS文件轉(zhuǎn)換的問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- gromacs氫鍵分析工具，g_hbond輸出結(jié)果解析？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 如何將amber的軌跡文件mdcrd格式轉(zhuǎn)換成gromacs的軌跡文件格式 trr呢
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請教gromacs蛋白與小分子相互作用分析
已經(jīng)有12人回復(fù)
- autodock與gromacs在Windows下的安裝
已經(jīng)有10人回復(fù)
- gromacs 模擬時如何固定金屬離子的問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- gromacs 模擬出現(xiàn)周期性問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 怎么用gromacs模擬混合溶劑？跪求大牛指導(dǎo)。。。
已經(jīng)有15人回復(fù)
- gromacs編譯安裝
已經(jīng)有11人回復(fù)
- Gromacs粗粒化力場（自己寫）
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 離子液體模擬：如何從別的軟件移植力場到Gromacs（itp文件的含義以及如何寫itp文件）
已經(jīng)有4人回復(fù)
- gromacs自己添加residue遇到的問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- gromacs水中的溶菌酶案例,哪出錯了?
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 如何用MS的納米管坐標(biāo)轉(zhuǎn)到gromacs可識別的文件
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求Gromacs中文手冊
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 請教GROMACS安裝
已經(jīng)有8人回復(fù)
- [新手求教]安裝Gromacs后，查看pdb2gmx命令，顯示無此命令
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】GROMACS分析程序討論，在gromacs中添加Amber力場
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】這是我安裝gromacs過程，但是出錯阿，這個怎么辦呢？謝謝
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】重金求助：gromacs中g(shù)_rms命令中怎樣應(yīng)用index.ndx文件
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】在gromacs的gro中插入小分子
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】求一個gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學(xué)起
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多嗎？如何選擇？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】NAMD和Gromacs哪個簡單？
已經(jīng)有5人回復(fù)
franksha
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1472.1
- 散金: 500
- 紅花: 1
- 帖子: 486
- 在線: 384.5小時
- 蟲號: 494131
- 注冊: 2008-01-11
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
2樓2015-07-03 15:26:34
|
; Temperature coupling is on tcoupl = Berendsen ; modified Berendsen thermostat tc-grps = Protein Non-Protein ; two coupling groups - more accurate tau_t = 0.1 0.1 ; time constant, in ps ref_t = 300 300 ; reference temperature, one for each group, in K annealing = single single annealing‐npoints = 4 4 annealing‐time = 0 10 20 55 0 10 20 55 annealing‐temp = 300 313 323 293 300 313 323 293 出現(xiàn)這樣的錯誤 Fatal error: Found 0 annealing-npoints values for 2 groups |
3樓2015-07-03 20:08:44
4樓2015-07-03 20:10:21
青青白白123
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 174.6
- 帖子: 123
- 在線: 28.3小時
- 蟲號: 7408360
- 注冊: 2017-11-01
- 專業(yè): 工程熱物理相關(guān)交叉領(lǐng)域
5樓2018-01-30 16:24:28
6樓2018-01-31 19:10:56
7樓2018-05-30 11:15:31
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 wyangdao 的主題更新
| 7 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +4 | chuanzhu川燭 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 南昌大學(xué)材料專碩311分求調(diào)劑 +6 | 77chaselx 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
[考研] 一志愿山大07化學(xué) 332分 四六級已過 本科山東雙非 求調(diào)劑！ +3 | 不想理你 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +3 | Jack?k?y 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +4 | ydfyh 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | Ma_xt 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 271材料工程求調(diào)劑
+8
|
.6lL 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +7 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料求調(diào)劑，總分315（英一） +5 | sbdksD 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿南京航空航天大學(xué)289分 +3 | @taotao 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] A區(qū)線材料學(xué)調(diào)劑 +5 | 周周無極 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 廣西大學(xué)家禽遺傳育種課題組2026年碩士招生（接收計算機(jī)專業(yè)調(diào)劑） +3 | 123阿標(biāo) 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081700化工學(xué)碩調(diào)劑 +3 | 【1】 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +6 | lemonzzn 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) 305求調(diào)劑 +4 | FY_yy 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學(xué)材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學(xué)一志愿川大藥學(xué)327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|