 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1064 | 回復: 8 | |||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
oyljw至尊木蟲 (職業(yè)作家)
格物致知Professional
|
[交流]
【求助】怎樣固定某個分子（不優(yōu)化）優(yōu)化其它分子 ？
|
||
|
請問： 想優(yōu)化兩個分子之間的相互作用，能把某個分子固 定住（不優(yōu)化）先優(yōu)化另一個分子嗎？這是凍結(jié)核嗎？ 想固定優(yōu)化，需要把坐標后面加上0，還需不需要其他的？ |
回復此樓» 猜你喜歡
求助火焰封管的時候管子炸了
已經(jīng)有1人回復
-
已知面上掛了，小學校實驗方向無平臺，感覺太難了
已經(jīng)有26人回復
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有105人回復
-
求助各位大佬，球球了，在這科薩頭
已經(jīng)有0人回復
-
請問四氫呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀時，如何使沉淀過程加速？
已經(jīng)有2人回復
-
半透性容器進行高濕或者低濕研究
已經(jīng)有0人回復
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最經(jīng)典的一本表面上化學相互作用教材
已經(jīng)有0人回復
-
誠邀有志之士加入江蘇大學環(huán)境學院合成生物學課題組！(長期接收學碩專碩、碩博連讀)
已經(jīng)有16人回復
-
一志愿南大理論與計算化學方向（070300）342分，求調(diào)劑
已經(jīng)有1人回復
-
歡迎化學、化工、物理、材料、或計算機背景的考研咨詢
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 高斯view怎么樣固定分子的對稱性進行優(yōu)化？
已經(jīng)有15人回復
- 構(gòu)象搜索與能量優(yōu)化有什么區(qū)別
已經(jīng)有5人回復
- 菜鳥求助，老師給了一個分子讓優(yōu)化，可總是錯誤，求大神指點
已經(jīng)有22人回復
- 高斯分子優(yōu)化及頻率計算
已經(jīng)有4人回復
- 如何能在優(yōu)化后得到這樣一個分子模型
已經(jīng)有5人回復
- 求助：請問各位高手在高斯09中優(yōu)化單個分子時如何把一部分的參數(shù)固定了，優(yōu)化其他部分
已經(jīng)有12人回復
- 分子優(yōu)化總是出錯，請大家?guī)兔?/a>
已經(jīng)有9人回復
- 高斯優(yōu)化構(gòu)建的小分子，為什么每次優(yōu)化后的坐標不完全相同？
已經(jīng)有8人回復
- 高斯計算中固定部分角度作優(yōu)化
已經(jīng)有10人回復
- 怎么利用chembio3D優(yōu)化自己畫的配體分子，求詳細步驟
已經(jīng)有8人回復
- vasp表面和吸附分子的結(jié)構(gòu)分別優(yōu)化后，如何將它們放到一起
已經(jīng)有11人回復
- 如何讓高斯在優(yōu)化結(jié)構(gòu)時保持其中某個單鍵不變
已經(jīng)有7人回復
- 確定分子點群之后，優(yōu)化得到的分子點群為什么還是會變
已經(jīng)有4人回復
- 如何用高斯分析分子勢能在某個振動模式下的分布
已經(jīng)有3人回復
- 求助如何固定原子坐標進行優(yōu)化，快搞瘋了
已經(jīng)有16人回復
- 求助關(guān)于水分子優(yōu)化后的鍵長鍵角
已經(jīng)有3人回復
- 如何 用高斯 固定部分原子 進行優(yōu)化
已經(jīng)有4人回復
- 求問一般優(yōu)化小分子結(jié)構(gòu)用什么方法和機組
已經(jīng)有10人回復
- 高斯對多分子體系的構(gòu)型優(yōu)化
已經(jīng)有4人回復
- 【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】
已經(jīng)有22人回復
- 【求助】請教有關(guān)應用高斯軟件優(yōu)化分子結(jié)構(gòu)時的問題
已經(jīng)有6人回復
- 【求助】請問Gaussian在優(yōu)化過程中可以固定某兩個分子不動嗎？
已經(jīng)有8人回復
- 【求助】如何固定某幾個原子不動？
已經(jīng)有20人回復
4樓2010-10-25 18:45:53
2樓2010-10-25 13:21:46
oyljw
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
格物致知Professional
- 應助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 16606.1
- 散金: 120
- 紅花: 27
- 帖子: 3191
- 在線: 1025.3小時
- 蟲號: 482354
- 注冊: 2007-12-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
3樓2010-10-25 18:37:08
oyljw
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
格物致知Professional
- 應助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 16606.1
- 散金: 120
- 紅花: 27
- 帖子: 3191
- 在線: 1025.3小時
- 蟲號: 482354
- 注冊: 2007-12-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
|
我看到版主的帖子了 “（3.2） 想固定某部分原子（鍵長、鍵角、二面角、相對位置、相對方向。。。。）怎么做？ Quote: 1.opt=modredundant 命令 在坐標后面寫上你要固定的原子序號，例如 1 2 f，限制1-2原子間鍵長 1 2 3 4 f，限制1-2-3-4原子間二面角 2.使用constants指定，如下例可以固定水的鍵角105.4度 O H1 O R H2 O R H1 A Variables: R 1.0 Constants: A 105.4 3.使用列標記，把直角坐標下的第二列改為-1，則會固定原子坐標， 改為比-1還小的數(shù)值，這些被改動的原子間的相對位置固定。 ” 感謝版主和樓上的！ |
5樓2010-10-26 11:13:42
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +3 | 26要上岸 2026-03-27 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 安徽大學專碩生物與醫(yī)藥專業(yè)(086000)324分，英語已過四六級，六級521，求調(diào)劑 +4 | 美味可樂雞翅 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈爾濱工業(yè)大學材料與化工方向336分 +4 | 辰沐5211314 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +4 | 星野? 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 315調(diào)劑 +4 | 0860求調(diào)劑 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 李嘉圖·S·路 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學一志愿南京師范大學303求調(diào)劑 +3 | zzffylgg 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +10 | Micky11223 2026-03-25 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +7 | prayer13 2026-03-23 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +13 | Faune 2026-03-21 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +3 | Amber00 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料考研求調(diào)劑 +3 | Dendel 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿上海交大生物與醫(yī)藥專碩324分，求調(diào)劑 +6 | jiajunX 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 網(wǎng)絡(luò)空間安全0839招調(diào)劑 +4 | w320357296 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 上海電力大學材料防護與新材料重點實驗室招收調(diào)劑研究生（材料、化學、電化學，環(huán)境） +4 | 我愛學電池 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學化學070300，求調(diào)劑
+7
|
2117205181 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學，分數(shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|