 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1710 | 回復(fù): 6 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
liqianjun木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
pdb文件，top文件
|
|
|
請問如何將Givew中導(dǎo)處的pdb格式轉(zhuǎn)化為NAMD的pdb格式？或者有沒有這樣的資料可供參考，看了NAMD的turorial，VMD tutorial，但還是不會弄 還有alpha羥基丙酸的topology file，大家有嗎？自己寫的話，我弄不懂里面的原子類型、impro如何寫。 謝謝，謝謝。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料考研調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
英一數(shù)一408，總分284，二戰(zhàn)真誠求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
085410 一志愿211 22408分數(shù)359求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
271求調(diào)劑
已經(jīng)有19人回復(fù)
-
385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿安徽大學(xué)計算機科學(xué)與技術(shù)學(xué)碩，331分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
318求調(diào)劑，計算材料方向
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有25人回復(fù)
-
一志愿北京科技大學(xué)085601材料工程英一數(shù)二初試總分335求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- gmx不認小分子PDB殘基怎么辦？？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】產(chǎn)生psf文件時出現(xiàn)的Missing atoms for conformation definition
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】水總?cè)ゲ坏�，請指點（已解決，謝謝各位幫助）
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】這是我安裝gromacs過程，但是出錯阿，這個怎么辦呢？謝謝
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】無法生成環(huán)糊精的psf文件
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】做NAMD的1K4C.pdb時候出現(xiàn)的錯誤
已經(jīng)有30人回復(fù)
- 【求助】求一個gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學(xué)起
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【專家會診】bay 討論namd,gmx處理水溶液,蛋白等MD 模擬;討論水及水通道
已經(jīng)有50人回復(fù)
- 【求助】如何生成聚乙烯的psf文件
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】只是優(yōu)化后文件，沒有restart文件，能繼續(xù)跑嗎
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【在線答疑】關(guān)于NAMD/VMD
已經(jīng)有210人回復(fù)
29050801
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1065.5
- 散金: 6
- 紅花: 1
- 帖子: 163
- 在線: 78.4小時
- 蟲號: 1765116
- 注冊: 2012-04-19
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學(xué)
7樓2013-10-03 16:07:37
chaizhm
木蟲 (著名寫手)
- 模擬EPI: 2
- 應(yīng)助: 123 (高中生)
- 貴賓: 0.25
- 金幣: 4787.4
- 散金: 139
- 紅花: 13
- 帖子: 1450
- 在線: 267.3小時
- 蟲號: 1253209
- 注冊: 2011-04-02
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
2樓2011-12-05 15:43:18
liqianjun
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1579
- 散金: 9
- 帖子: 246
- 在線: 125.4小時
- 蟲號: 665681
- 注冊: 2008-12-01
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
3樓2011-12-07 16:20:38
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
御劍江湖(金幣+2): 謝謝 2011-12-08 20:25:35
liqianjun(金幣+2): 謝謝，原來看了點topology tutorial,不過沒有會融會貫通靈活運用，你介紹的這個網(wǎng)頁感覺很有用，但還未理解消化，稍后再向你請教 2011-12-08 22:22:03
御劍江湖(金幣+2): 謝謝 2011-12-08 20:25:35
liqianjun(金幣+2): 謝謝，原來看了點topology tutorial,不過沒有會融會貫通靈活運用，你介紹的這個網(wǎng)頁感覺很有用，但還未理解消化，稍后再向你請教 2011-12-08 22:22:03
|
http://www.ks.uiuc.edu/Training/ ... ix-html/node22.html 仔細看看這個，看完之后你也許就能所有發(fā)現(xiàn)。 |
4樓2011-12-08 19:40:09
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | Gs大王 2026-04-02 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 342求調(diào)劑 +12 | Mary Keen 2026-03-28 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 生物與醫(yī)藥考研調(diào)劑 +5 | 鐵憨憨123425 2026-03-31 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑推薦 +9 | 清酒714 2026-03-26 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 零八# 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國科學(xué)院大學(xué)265求調(diào)劑 +8 | 恬淡ye 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 086000生物與醫(yī)藥298調(diào)劑求助 +4 | 元元青青 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +4 | 希望如此i 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 282求調(diào)劑 不挑專業(yè) 求收留 +4 | Yam. 2026-03-30 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +8 | 11ggg 2026-03-30 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 282求調(diào)劑 +3 | 呼吸都是減肥 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | AZMK 2026-03-29 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范化學(xué)332分求調(diào)劑 +3 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 304材料求調(diào)劑
+5
|
鐘llll 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +10 | 家佳佳佳佳佳 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 310求調(diào)劑 +10 | 爭取九點睡 2026-03-30 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +10 | 彼岸t 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +8 | 邱gl 2026-03-27 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 331環(huán)境科學(xué)與工程求調(diào)劑 +3 | 熠然好運氣 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856調(diào)劑 +5 | 求求讓我有書讀?/a> 2026-03-26 | 6/300 |
|