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相對定量測基因相對表達量,急。。!
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老師要求本人測定水稻抗旱相關的20多個基因的相對表達量,有四個樣。太多了,而且樣品有限。我沒有測擴增效率,直接用雙△法測表達量了。內參是用的UBQ5,一個印度人寫的。現(xiàn)在遇到很多問題,用的是TAKARA的熒光定量試劑盒, 1、好幾個基因CT值都大于35,我提高了模板濃度也不行(我沒測RNA濃度,直接測cDNA濃度,然后調成與試劑盒要求的DNA的量來做)。 2、PCR反應過程都按照說明書上設置了,沒改改動,循環(huán)數(shù)40個,因為不太會改。另外用primer5算出的溫度,還是用Oligo6算出的溫度?因為試劑盒說明書上只給出了Oligo6的溫度范圍。 3、我跑普通PCR的時候有時候沒條帶,但跑熒光的時候特異性很好。那是不是沒必要跑普通PCR了呢?不過我聽其他實驗室人說,要先跑梯度PCR,找出最適退火溫度,然后再上熒光PCR。 4、有時候有非特異性擴增,提高溫度了還不行,是不是要換引物了? 不好意思,本人新手不太懂,折騰了好幾千塊錢了,還沒出什么結果,很是焦急。求大神指導,不勝感激!! |

新蟲 (小有名氣)

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