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[交流]
做微衛(wèi)星分析電泳條帶怎么分析?
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| 我這段時間要做鼠類的微衛(wèi)星,用做種內(nèi)分析,因為以前從來沒接觸過動物方面的微衛(wèi)星,求教一下高手有沒有寫的詳細一些的文章好做參考?由于沒有所做的鼠的全基因組序列,就在大鼠和小鼠的序列上找了一些微衛(wèi)星位點用PCR篩選,PCR篩選出有條帶的引物用于下一步微衛(wèi)星分析,看文獻主要的方法好像就是非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,還有一種是用ABI的儀器不知道是不是毛細管電泳?后面怎么分析?我做的量比較大,求教高手那種方法好一點?有沒有具體的文獻或者書能不能介紹一下?謝謝! |
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本人也剛開始做微衛(wèi)星,過來跟樓主交流下。微衛(wèi)星分析可以用聚丙烯酰胺凝膠電泳也可以用熒光標(biāo)記引物做微衛(wèi)星分型。聚丙烯跑膠需要摸索條件,工作量大一點;熒光分型有儀器的話自己可以做,但好像比較麻煩,我不會,所以送公司分型,那工作量就只有PCR那么一點點。后續(xù)的結(jié)果處理按工作量來說二者就差不多了。但聚丙烯酰胺凝膠電泳會出現(xiàn)影子帶什么的問題,對有選擇障礙的人來說比較糾結(jié)。 啰啰嗦嗦這么多,請樓主不要嫌煩啊。 PS.這方面文獻倒挺多的,不清楚的話找?guī)灼┦空撐南瓤粗。祝樓主好運! |
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