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lt7912

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[交流] 做微衛(wèi)星分析電泳條帶怎么分析？

我這段時(shí)間要做鼠類(lèi)的微衛(wèi)星，用做種內(nèi)分析，因?yàn)橐郧皬膩?lái)沒(méi)接觸過(guò)動(dòng)物方面的微衛(wèi)星，求教一下高手有沒(méi)有寫(xiě)的詳細(xì)一些的文章好做參考？由于沒(méi)有所做的鼠的全基因組序列，就在大鼠和小鼠的序列上找了一些微衛(wèi)星位點(diǎn)用PCR篩選，PCR篩選出有條帶的引物用于下一步微衛(wèi)星分析，看文獻(xiàn)主要的方法好像就是非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳，還有一種是用ABI的儀器不知道是不是毛細(xì)管電泳？后面怎么分析？我做的量比較大，求教高手那種方法好一點(diǎn)？有沒(méi)有具體的文獻(xiàn)或者書(shū)能不能介紹一下？謝謝！

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1樓 2012-07-31 20:02:20

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鳳凰-涅磐

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不太清楚，只是過(guò)來(lái)逛逛

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3樓2012-08-01 09:22:02

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ZOEY21

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本人也剛開(kāi)始做微衛(wèi)星，過(guò)來(lái)跟樓主交流下。微衛(wèi)星分析可以用聚丙烯酰胺凝膠電泳也可以用熒光標(biāo)記引物做微衛(wèi)星分型。聚丙烯跑膠需要摸索條件，工作量大一點(diǎn)；熒光分型有儀器的話自己可以做，但好像比較麻煩，我不會(huì)，所以送公司分型，那工作量就只有PCR那么一點(diǎn)點(diǎn)。后續(xù)的結(jié)果處理按工作量來(lái)說(shuō)二者就差不多了。但聚丙烯酰胺凝膠電泳會(huì)出現(xiàn)影子帶什么的問(wèn)題，對(duì)有選擇障礙的人來(lái)說(shuō)比較糾結(jié)。
啰啰嗦嗦這么多，請(qǐng)樓主不要嫌煩啊。
PS.這方面文獻(xiàn)倒挺多的，不清楚的話找?guī)灼┦空撐南瓤粗�。祝樓主好運(yùn)！

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2樓2012-08-01 09:12:43

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引用回帖:

2樓: Originally posted by ZOEY21 at 2012-08-01 09:12:43
本人也剛開(kāi)始做微衛(wèi)星，過(guò)來(lái)跟樓主交流下。微衛(wèi)星分析可以用聚丙烯酰胺凝膠電泳也可以用熒光標(biāo)記引物做微衛(wèi)星分型。聚丙烯跑膠需要摸索條件，工作量大一點(diǎn)；熒光分型有儀器的話自己可以做，但好像比較麻煩，我不會(huì)， ...

我現(xiàn)在用大鼠，小鼠，還有其他一些鼠類(lèi)設(shè)計(jì)好的引物做PCR摸索出一些引物可能能用，又優(yōu)化了一下反應(yīng)條件和Mg2+濃度，跑膠用的是1.5%的瓊脂糖凝膠，再往后做可能就要用聚丙烯酰胺電泳了。。�？傆X(jué)得那樣做太費(fèi)事了，一塊膠跑不了多少個(gè)樣。那你們送那個(gè)公司？大概需要多少錢(qián)？

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4樓2012-08-03 12:24:52

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有沒(méi)有人知道，純合子和雜合子在分型中起到什么作用？

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6樓2012-08-06 23:44:21

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