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雙酶切后載體片段變小
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本人實驗中遇到點問題，現(xiàn)將詳細過程書寫如下，并附帶詳細的參考信息。 目的基因長度：900bp 目的基因的前端有NdeI酶切位點，后端有BamHI酶切位點。目的基因是由公司合成好以后構(gòu)建到pGEM-T載體上，轉(zhuǎn)化到DH5α中。 pET3a（大小4640bp） pET20b（大小3716bp） 以及pGEM-T（大小3000bp）都是轉(zhuǎn)化到DH5α中，提取質(zhì)粒以后做雙酶切的時候都載體的大小正確（如圖1），可以排除同源重組的可能性。 圖1 （圖1）提取質(zhì)粒后做雙酶切，從圖中可以看到pET3a和pT-taget質(zhì)粒都已經(jīng)完全切開，且載體與目的基因的大小都正確。注：pT-taget雙酶切以后載體有兩條帶，這是因為目的基因和T載體上都帶有NdeI酶切位點，目的基因的末端A與T載體的T相連時存在正反向相連兩種情況，目的基因大小為900bp左右，所以在沒有完全切開質(zhì)粒的時候載體會與兩種情況，大小相差900bp左右。 圖2 （圖2）目的基因雙酶切后分別與pET3a和pET20b相連接，轉(zhuǎn)化DH5α細胞，挑取單克隆提質(zhì)粒雙酶切后的電泳結(jié)果。圖中用DH5α中提取的pET3a和pET20b質(zhì)粒做的雙酶切作為載體的對照；連接后雙酶切目的基因的條帶大小正確，但載體的大小發(fā)生改變，都比原先載體片段小。 我的問題就是，為什么連接了以后原先的載體會變�。ㄒ呀�(jīng)重復(fù)了多次實驗，更換了感受態(tài)細胞，重新提質(zhì)粒，重新酶切的載體等等）。 圖3 （圖3）pET3a-target與pET20b-target分別用NdeI和BamHI做單酶切；3a加目的基因條帶應(yīng)該在5000左右，處于Marker10000中從上數(shù)第三條帶4000以上，然而切出來的條帶位于4000一下；同樣，20b載體單酶切后加上目的條帶也應(yīng)在4000以上。 總的來說，目的基因連入載體以后，載體序列酶切后發(fā)生的構(gòu)象的改變，導(dǎo)致條帶位置發(fā)生改變，請問這具體的原因是什么呢？ pGEM-T pET-3a pET-20b [ Last edited by shoppinggirl on 2012-8-18 at 19:13 ] |
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