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bob1987

鐵蟲 (初入文壇)

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專業(yè): 生物化學

[交流] QPCR引物設計

大家好，
我設計了一對引物想檢測兩種不同的剪接體，這兩個剪接體只是外顯子1不同，其他都一樣。參見和后面的序列圖。
我為了讓他們跨外顯子，因此在外顯子1和2的交界處設計引物。我設計的引物如下：
a上游：5’-GAG TGA CAT AGA GTG TGC TGC-3‘
a下游：5’-GGT CAC TGG AAG ATA TGG C-3‘
c上游：5’-CTA TGC TGC T GTG TGC TG-3‘
c下游：5’-GGT CAC TGG AAG ATA TGG C-3‘
上游引物中藍色區(qū)域與紅色區(qū)域是相同的而且是在外顯子2中，其他是在不同的外顯子1中，他們的下游是一樣的。我想問一下以cDNA為模板，用這兩個引物擴出來的產物會一樣嗎？
這是序列圖以及上游引物的位置：

圖片3.jpg

[ Last edited by bob1987 on 2013-9-2 at 20:15 ]

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1樓 2013-09-02 19:56:48

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