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wendywan鐵桿木蟲 (小有名氣)
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[求助]
real time PCR 結(jié)果很詭異,求助高手。。!
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最近一直做關(guān)于VEGF gene 的Real time PCR 試驗,用的是roche 480跑的pcr。 詭異的地方在于: 1 第一次sample 濃度為50ng/ul,20ul體系上樣6ul,GAPDH 作為內(nèi)參,結(jié)果顯示出來的CT值為9-10左右,組內(nèi)有人說GAPDH一般在13-15左右才會用,低于13都不會用。覺得我應(yīng)該稀釋模板。但是第一次改有的趨勢都正常。且BDNF作為陽性ctrl,也是正常的。 2 第二次用同樣的sample做。模板濃度稀釋為10ng/ul。上樣5ul。還是GAPDH作為內(nèi)參。這次的結(jié)果是GAPDH 的平均CT 值在14-16之間。結(jié)果目的基因出來的結(jié)果是該減少的全部增加了。不知道哪次的結(jié)果是正常的? 想問的還有:一般在RNA提出來是測的濃度,作為矯正內(nèi)參的參考。之后在測cDNA濃度是否沒啥用處了,有人說在做反轉(zhuǎn)時加了dNTP后,會影響吸光值,所以cDNA的濃度壓根就不準(zhǔn)。是否是這樣的? 為什么模板稀釋的濃度不一樣,會出現(xiàn)這么大的差異?像我這種情況,究竟哪次的結(jié)果比較準(zhǔn)確? 期待大家的幫忙啊!捉急。。。。。。。 |

鐵桿木蟲 (小有名氣)

銅蟲 (小有名氣)
| 相對定量一般都是反轉(zhuǎn)錄的時候把RNA粗略定量一下就好了,cDNA不用定量的,不過反轉(zhuǎn)錄完一般確實是需要稀釋的,稀釋個5到10倍都可以,這個要看RNA濃度了,內(nèi)參的作用是在數(shù)據(jù)分析的時候用的,一般的Ct值落在15-30之間比較好,如果cDNA不稀釋確實會影響定量結(jié)果,但是一般不會有特別大的影響,,我覺得還是以稀釋后的定量結(jié)果為準(zhǔn),至于你說結(jié)果不好的話是不是你把樣本放錯了。 |

銅蟲 (小有名氣)

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