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林默淚新蟲 (初入文壇)
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克隆轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化子就是不含目的基因。
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我的目的基因是750bp,質(zhì)粒載體是PET-24a。 我從我?guī)熜值木崛≠|(zhì)粒,然后用KOD酶PCR目的基因。 然后兩步酶切質(zhì)粒和目的基因。NdeI酶切,膠回收,再BamHI酶切,再回收。酶切時間是3個小時以上。 提質(zhì)粒、PCR、回收后都有電泳檢測,條帶位置正確。 然后用東洋紡的高效鏈接液鏈接目的基因和質(zhì)粒的酶切片段。連接時間大概時2個小時以上。 轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細胞JM109,熱擊法。 然后培養(yǎng)在含Kan+的平板上。 第一次沒有長,第二次4個平板,只有一個平板上長了3個,第三次,4個平板上都有,每個大約3—5個。 PCR檢測,都沒有P出目的片段。 想請教下各位大神,大概會是什么問題,那些地方需要改進。 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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新蟲 (初入文壇)
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我的目的基因是750bp,質(zhì)粒載體是PET-24a。 我從我?guī)熜值木崛≠|(zhì)粒,然后用KOD酶PCR目的基因。 然后兩步酶切質(zhì)粒和目的基因。NdeI酶切,膠回收,再BamHI酶切,再回收。酶切時間是3個小時以上。 提質(zhì)粒、PCR、回收后都有電泳檢測,條帶位置正確。 然后用東洋紡的高效鏈接液鏈接目的基因和質(zhì)粒的酶切片段。連接時間大概時2個小時以上。 轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細胞JM109,熱擊法。 然后培養(yǎng)在含Kan+的平板上。 第一次沒有長,第二次4個平板,只有一個平板上長了3個,第三次,4個平板上都有,每個大約3—5個。 PCR檢測,都沒有P出目的片段 從你描述來看,pET載體應(yīng)該是雙酶切完全了.(但是一般情況下要注意 載體上兩個酶切位點之間的片段有多長?膠回收的時候有沒有看到切出來的片段? 如果載體沒切干凈,那可能會長出很多載體自連的假克隆.) 你的問題很可能出在PCR產(chǎn)物的酶切. 首先,你的引物5'端加了保護堿基嗎?如果沒有,酶切會變得相對困難. 第二,BamHI 不太好切, 而且你的酶切時間是3小時左右,所以很可能PCR產(chǎn)物上的BamHI沒切動或者效率很低. 有一個麻煩點的辦法是,你先把PCR產(chǎn)物連接到T-載體上,(如果沒有T-載體,隨便找個載體,,酶切,補平然后去磷,PCR產(chǎn)物加磷,用平末端連接),然后再從T-載體上把你的目的基因用NdeI和BamHI 切下來,這樣做你就能確定目的基因的兩端肯定是切開了的. 如果還長不出克隆,那就不是酶切,連接的問題了(當(dāng)然,你要確定你的感受態(tài)細胞是正常的) |
金蟲 (初入文壇)
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