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berry94鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
高GC含量目的基因的克隆 已有14人參與
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| 大家好,我要克隆一個(gè)1.2K的目的基因,GC含量70%,克隆了很長(zhǎng)時(shí)間了,一直沒(méi)有什么進(jìn)展,特地來(lái)向前輩們求助。個(gè)人認(rèn)為RNA提取應(yīng)該是很好的,一直覺(jué)著反轉(zhuǎn)錄得不好,我用的promega A5000的反轉(zhuǎn)錄試劑盒,48度、50度反轉(zhuǎn)過(guò),都沒(méi)有擴(kuò)出條帶,做RACE也沒(méi)有得到結(jié)果,所以希望有經(jīng)驗(yàn)者提下意見(jiàn),讓晚輩進(jìn)步! |

木蟲 (正式寫手)
小蟲
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GC含量那么高,而且又是1200bp的模板,普通酶應(yīng)該擴(kuò)增不出來(lái),最好是使用專門用于長(zhǎng)片段擴(kuò)增的酶,也不要盲目的只選擇高保真酶,畢竟高保真酶還是保真性居首位,不一定能對(duì)長(zhǎng)片段的進(jìn)行擴(kuò)增啊。 對(duì)于高GC的模板,優(yōu)化是一定不能少的,如果你購(gòu)買的試劑盒中有直接是供高GC擴(kuò)增的buffer的話,是最好的,這樣就不用額外進(jìn)行鎂離子、DMSO的優(yōu)化了,操作起來(lái)簡(jiǎn)單方便的,如果有熱啟動(dòng)又長(zhǎng)片段擴(kuò)增的 最好不過(guò)了 (現(xiàn)在市場(chǎng)上極少極少的) 選酶是關(guān)鍵,buffer也是關(guān)鍵 希望有所幫助哦 |

銀蟲 (初入文壇)
| 我做的基因就是GC含量很高的,如果你懷疑反轉(zhuǎn)錄有問(wèn)題,你可以用一段小一點(diǎn)的比較好P的引物來(lái)試一下能不能P出來(lái),我P的時(shí)候都會(huì)加DMSO幫助解鏈,然后我感覺(jué)引物的設(shè)計(jì)也很重要,個(gè)人體會(huì),用的兩對(duì)引物,一對(duì)就怎么也p不出來(lái),然后換了一對(duì)引物就很輕松的p出來(lái)了,用的GXL |
鐵蟲 (初入文壇)
銀蟲 (正式寫手)

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