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wyqzl新蟲 (初入文壇)
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[求助]
DNA，mRNA，CDS，ORF，cDNA,gene的關(guān)系是什么 已有6人參與
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求大神指導(dǎo)啊，最近在學(xué)習(xí)生物信息學(xué)，然后在網(wǎng)上下載序列的時(shí)候發(fā)現(xiàn)有的是mRNA,有的是CDS，有的是cDNA，后來又遇到ORF,gene這幾個(gè)東西，實(shí)在沒搞清楚，這幾者之間的關(guān)系是什么，他們分別指什么？然后想問問genomic sequence又是啥東西 (R050U]BD]RJ~LC[H`V_(BI.jpg 9JY]U4WGDU}~EE{Z29FE0{G.jpg QA(GNF{D4470}CP$G{]QSTV.jpg |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wyqzl: 金幣+8, ★★★很有幫助 2015-06-17 10:06:26
wyqzl: 金幣+8, ★★★很有幫助 2015-06-17 10:06:26
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專為此貼發(fā)了一貼： http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=9037650 |
15樓2015-06-09 18:30:04
halfbeer
捐助貴賓 (小有名氣)
這是啥？
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★
wyqzl: 金幣+4, ★★★很有幫助 2015-07-09 08:43:23
wyqzl: 金幣+4, ★★★很有幫助 2015-07-09 08:43:23
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聲明：這個(gè)是我從另一個(gè)帖子找來的，不是我的，我看著各位回復(fù)的揪心。。。。 genome：一個(gè)物種的全部遺傳物質(zhì)，真核生物包括核基因和質(zhì)基因； gene：按最新的分子生物學(xué)解釋，包括表達(dá)這個(gè)基因產(chǎn)物的全部DNA序列，包括ORF序列，內(nèi)含子外顯子，啟動(dòng)子，3'UTR，5'UTR，以及調(diào)控區(qū)； ORF：在mRNA上從起始密碼子到終止密碼子之間的一段序列，該段序列可能編碼蛋白質(zhì)，也可能不編碼； CDS：能翻譯成氨基酸序列的DNA序列，從起始密碼子到終止密碼子，也就是說CDS與所翻譯的氨基酸序列存在嚴(yán)格的3對(duì)1的關(guān)系； mRNA:基因轉(zhuǎn)錄后加工成熟用于翻譯蛋白質(zhì)的序列，包括ORF（此時(shí)ORF與CDS相同）序列，3'UTR，5'UTR，5'帽子及3'Poly (A)尾； hnRNA:核不均一RNA，是指轉(zhuǎn)錄獲得的最原始序列，沒有經(jīng)過任何加工，序列包含從轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)到轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)的全部序列； cDNA：通過mRNA反轉(zhuǎn)錄所得，與mRNA序列互補(bǔ)的單鏈DNA或者與mRNA對(duì)應(yīng)的DNA雙鏈； EST：表達(dá)序列標(biāo)簽，是指從一個(gè)隨機(jī)選擇的cDNA 克隆，進(jìn)行5’端和3’端單一次測(cè)序挑選出來獲得的短的cDNA 部分序列,代表一個(gè)完整基因的一小部分，在數(shù)據(jù)庫中其長度一般從20 到7000bp 不等，平均長度為360 ±120bp。由于cDNA文庫的復(fù)雜性和測(cè)序的隨機(jī)性，有時(shí)多個(gè)EST代表同一基因或基因組，將其歸類形成EST簇（EST cluster)； 幾者關(guān)系： 1、DNA就是表示一段脫氧核糖核酸序列； 2、包含關(guān)系：gene ∈ genome；EST ∈ cDNA；CDS ∈ ORF；mRNA ∈ hnRNA 說明：基因組上包含若干基因，不多說；一段mRNA上可能包含很多個(gè)ORF（只要是以起始密碼子開始，終止密碼子結(jié)束），但是只有能翻譯成蛋白質(zhì)的ORF才能稱之為CDS；EST序列是在隨機(jī)測(cè)序過程中獲得的cDNA序列的一部分；hnRNA需要經(jīng)過加工，生成成熟的功能RNA，一條hnRNA可能加工成多條mRNA，也有可能不加工成mRNA而是其他功能RNA，如rRNA，tRNA，核酶等； 3、映射關(guān)系：mRNA & cDNA mRNA與cDNA單鏈互補(bǔ)，且A與U互補(bǔ) |
16樓2015-06-10 09:03:39
bryantchow
禁蟲 (小有名氣)
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
nono2009: 金幣-10, 應(yīng)助指數(shù)-1, 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 嚴(yán)禁回帖廣告 2015-06-08 13:44:48
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nono2009: 金幣-10, 應(yīng)助指數(shù)-1, 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 嚴(yán)禁回帖廣告 2015-06-08 13:44:48
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2樓2015-06-04 20:21:38
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頂一下 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
3樓2015-06-05 07:33:12
wyqzl
新蟲 (初入文壇)
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wyqzl
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5樓2015-06-05 09:15:26
bryantchow
禁蟲 (小有名氣)
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6樓2015-06-06 09:59:48
yangjingjing
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Cindycclove
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