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amq7392鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助/交流】請教blast結(jié)果的解讀 已有6人參與
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| 將細菌16S rDNA序列提交到GenBank進行比對，得到的比對結(jié)果中，有Max score, total score, Max ident等幾項，請問哪項指標代表序列最相似？因為我發(fā)現(xiàn)有時候score最大者其max ident卻不是最大。 |
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4樓2010-10-19 08:00:34
★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
scelab(金幣+3):謝謝交流！:tiger06: 2010-10-07 23:24:30
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我記得total score是該條比對結(jié)果與query的總符合的比例，例如94%意為query序列中總共有94%的序列與該結(jié)果能對應(yīng)。 Max score是最大的一段能與結(jié)果對應(yīng)的序列占query的比例。 Max ident是query能與該條比對結(jié)果對應(yīng)的序列中出現(xiàn)的最高的一致度。 score大的比對結(jié)果不見得Max ident就最大，這很正常。一般兩者都高的結(jié)果就最接近于真實 |
2樓2010-10-07 23:09:53
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5樓2010-10-19 08:30:30
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