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知音者2新蟲 (初入文壇)
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[求助]
PCR出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,求高手解答
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體系:2xmix 12.5ul,引物(Im26-f,Im3r)各0.5ul,ddw10.5,模版200ng,1ul。程序94 5min,94 30s,56 30s,72 60s,72 7min,30個(gè)循環(huán)。出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,求高手解答 |
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木蟲 (職業(yè)作家)
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樓主,需要把你的PCR具體信息給出才好分析,例如,引物濃度,你的引物是如何設(shè)計(jì)的,目標(biāo)片段是多少等等,其次,你的PCR目的是什么,如果是為了做QPCR,非特異帶是絕對(duì)不允許的,如果只是做MAKRE倒是關(guān)系不大,如果是克隆基因或做表達(dá),只克隆目標(biāo)就可以了,請(qǐng)說(shuō)明你的意圖。 其次,可以提高退火溫度,降低鎂離子濃度,加入適量DMSO提高特異性。 |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (正式寫手)
金蟲 (正式寫手)
| 首先,確定你的非特異性帶是怎么來(lái)的,也就是簡(jiǎn)單地做一個(gè)無(wú)模板對(duì)照,一般做PCR最后做一個(gè)陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照,看你的操作是否有誤或者試劑有無(wú)污染之類的,如果是你比較成熟的體系,可以不做對(duì)照,但是如果是剛開始一個(gè)新的程序,最好還是做個(gè)陰性對(duì)照,排除是水或者試劑的污染造成的非特性帶,然后才是看是否由于退火溫度引起的。一般情況下PCR的退火溫度要根據(jù)你的引物Tm值來(lái)確定,一般是比引物Tm值低3度左右,當(dāng)然有的高保真酶是要求比引物Tm值高;有非特異性條帶的另一種可能是你設(shè)計(jì)的引物剛好在基因組其他地方也能擴(kuò)增,也就是引物的特異性不是很好,你設(shè)計(jì)好引物后,可以先Blast一下。希望能幫助你。 |

金蟲 (正式寫手)
Dreamer

金蟲 (正式寫手)

木蟲 (正式寫手)
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