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大臉貓貓喵金蟲 (初入文壇)
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[求助]
NdeI,BamHI雙酶切
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| 我用NedI和BamHI雙酶切我的目的片段然后和28a連接。試著改變了多次酶切酶連條件,但一直都轉(zhuǎn)化不出來。28a切完后跑電泳與質(zhì)粒比較應(yīng)該是切開的,F(xiàn)在不知道問題到底是出在哪里了。求各位幫忙分析一下,可能的原因以及解決的方案吧~謝謝~~感激不盡! |
新蟲 (初入文壇)
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1.如果你有含插入基因(最好大于1kb,愈大更好)的pET類載體,還可再用NdeI/BamHI雙切則比較方便,直接用NdeI/BamHI雙切,低濃度加長膠電泳可回收到酶切好的高質(zhì)量的pET-NdeI/BamHI備用載體;若只有原始載體,因?yàn)镹deI或BamHI均不能保證100%切開,特別NdeI大致只有70%,因此你雙酶切的載體中大致有30%的載體僅僅是完成單切,因此你的載體再連接時(shí),相當(dāng)于連接液中原始載體特別高,而目的連接載體不多,需要篩選比較多的克隆才可能篩選到你的目標(biāo)克。 2.其次,由于插入用載體質(zhì)量差,連接時(shí)還是按連接說明書中載體/基因=1:5的比例,那么合格的連接所占比例就非常低,轉(zhuǎn)化篩選自然困難;此時(shí)可用可用1:1或2:1比例; 3.NdeI的保護(hù)堿基比較特別,可在百度中輸入“限制性內(nèi)切酶保護(hù)堿基”,可查找到有關(guān)保護(hù)堿基設(shè)計(jì)的文章參考,不然你的插入基因根本就沒有NdeI粘端,自然連接轉(zhuǎn)化不成功; 4.感受態(tài)質(zhì)量可通過平行用未酶切的載體作為對照,應(yīng)該長出很多陽性克隆,若對照都沒長,自然表明感受態(tài)不好; 5.電轉(zhuǎn)化時(shí),由于多數(shù)時(shí)候用的都是反復(fù)使用的舊電轉(zhuǎn)杯,而電極鋁片氧化嚴(yán)重,再按常規(guī)電轉(zhuǎn)參數(shù)自然效率不高,可用細(xì)砂紙打磨下電極除掉氧化層,外側(cè)方便打磨,內(nèi)側(cè)可將砂紙裁成小條,用硬薄片物頂住輕輕打磨好,再用DDW沖洗干凈,超凈工作臺(tái)內(nèi)紫外燈照射并吹干后再用。 6.若你的實(shí)驗(yàn)室不差錢,對于用pET原始載體進(jìn)行雙酶切的操作可再酶切1.5h后加入堿性磷酸酶(如FastAP)進(jìn)行脫磷酸處理,65℃滅活后再膠回收,連接時(shí)比例用載體/基因=1:1比例連接,再轉(zhuǎn)化。 祝你實(shí)驗(yàn)順利! |
榮譽(yù)版主 (著名寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +24 |

木蟲 (小有名氣)
銀蟲 (初入文壇)
| 你的目的片段是PCR產(chǎn)物還是已經(jīng)連在了克隆載體上?如果是直接用PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切,可能會(huì)比較困難,而且要看你有沒有在酶切位點(diǎn)兩端加上保護(hù)堿基。如果是從克隆載體上雙酶切,那就要測序檢查一下酶切位點(diǎn)是否為唯一的在目的片段兩端。 |
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