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永遠(yuǎn)一片天

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[求助] 如何利用文獻(xiàn)找到的引物查找目的模板？

如何利用文獻(xiàn)找到的引物查找目的模板？驗(yàn)證引物的特異性和正確性··

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1樓 2013-11-21 18:21:17

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永遠(yuǎn)一片天

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2樓: Originally posted by soarrow at 2013-11-21 19:12:46
還是blast，選擇blastn
引物，上游和下游一起輸入，中間空幾個(gè)---
database 選擇 Others
Optimize for 選擇 Somewhat similar sequences.....

比對(duì)出來(lái)的數(shù)據(jù)就能進(jìn)一步找到你想要的信息，包括模板序列等等等 ...

可是，會(huì)有好多模板的，我不知道要選哪一個(gè)？比如，上CAACCGTACAGAATGAAGCGG
下TTATTCGTGCAATACTCGTGCG

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3樓2013-11-21 19:57:56

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永遠(yuǎn)一片天: 金幣+5, ★★★很有幫助 2013-11-21 19:56:57

還是blast，選擇blastn
引物，上游和下游一起輸入，中間空幾個(gè)---
database 選擇 Others
Optimize for 選擇 Somewhat similar sequences.....

比對(duì)出來(lái)的數(shù)據(jù)就能進(jìn)一步找到你想要的信息，包括模板序列等等等等

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2樓2013-11-21 19:12:46

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soarrow

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3樓: Originally posted by 永遠(yuǎn)一片天 at 2013-11-21 19:57:56
可是，會(huì)有好多模板的，我不知道要選哪一個(gè)？比如，上CAACCGTACAGAATGAAGCGG
下TTATTCGTGCAATACTCGTGCG...

汗，選擇跟自己研究方向有關(guān)的，或者是周圍能找得到的or買得到的

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4樓2013-11-21 21:39:43

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jingmi

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請(qǐng)問(wèn)您輸入的是下游引物的反向互補(bǔ)序列嗎

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5樓2015-01-09 16:43:11

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