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請問qRT-PCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線中擴(kuò)增效率過高是怎么回事 已有3人參與
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我在做4個(gè)目的基因和一個(gè)內(nèi)參基因qRT-PCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí),擴(kuò)增效率全部都超過了120%,最高的甚至達(dá)到190%。我現(xiàn)在唯一能確定的就是在加樣的過程中不同稀釋梯度(10倍的梯度)的模板cDNA在加樣過程中有相互污染,所以Ct值也不成線性的變化。我現(xiàn)在就是再重新做并嚴(yán)格避免污染,但是除了我確定的這個(gè)原因,還有其他的一些什么原因可能導(dǎo)致了擴(kuò)增效率過高呢? 請有經(jīng)驗(yàn)的高手指教,非常謝謝! 還有一個(gè)問題,就是我的內(nèi)參基因本身的豐度比其他4個(gè)目的基因的高很多,因?yàn)榧词鼓0逑♂屃?0^5倍了,但Ct值也沒有超過20,而其他的目的基因的Ct值都在24到31之間,這種內(nèi)參基因和目的基因本身的豐度懸殊這么大,這樣的內(nèi)參可以用來作為內(nèi)參嗎?是不是找一個(gè)與目的基因相當(dāng)?shù)牟判心?感謝解惑! |
金蟲 (正式寫手)
琴美喜歡發(fā)呆 不喜歡發(fā)脾氣
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... 1. 引物不合適,不僅僅有擴(kuò)增效率不夠100%的情況出現(xiàn),同樣也有擴(kuò)增效率超過100%的情況,普通認(rèn)為90~110%的擴(kuò)增效率比較合適。你的擴(kuò)增效率過高,你需要在引物上下下工夫。 2. 這樣的內(nèi)參肯定不合適,內(nèi)參有很多,建議第一次做的時(shí)候,多上幾個(gè)內(nèi)參(3個(gè)左右)一起看看比較合適。 祝實(shí)驗(yàn)順利,說的不周之處希望高手指點(diǎn) |

鐵桿木蟲 (正式寫手)

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