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yesxing2011新蟲 (初入文壇)
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[求助]
質(zhì)粒構(gòu)建的問(wèn)題
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大家好,在此求助個(gè)問(wèn)題,感謝回答: 《質(zhì)粒構(gòu)建》 引物退火形成insert后,測(cè)shRNA濃度 酶切3h,回收后,測(cè)dsDNA濃度 連接16°c,3h (質(zhì)粒與insert濃度比為1:5) 轉(zhuǎn)化: 1、實(shí)驗(yàn)組:連接產(chǎn)物10ul加到100ul感受態(tài)細(xì)胞中 2、對(duì)照組a:酶切后,不加insert,同樣加入ligation進(jìn)行連接 對(duì)照組b:感受態(tài)細(xì)胞不加連接產(chǎn)物,其他條件一樣,進(jìn)行轉(zhuǎn)化 對(duì)照組c:酶切后,不加insert,也不加ligation 結(jié)果:實(shí)驗(yàn)組均長(zhǎng)出2-8個(gè)菌落 對(duì)照組a 長(zhǎng)出15個(gè)菌落 對(duì)照組b 不長(zhǎng) 對(duì)照組c 長(zhǎng)出3個(gè)菌落 問(wèn)題: 奇怪的是,同樣的雙酶切后載體,為什么沒(méi)加insert的平板長(zhǎng)出的菌落比加了insert的長(zhǎng)得還要多??難道還有連接上又有不表達(dá)的???這個(gè)怎么解釋呢? insert進(jìn)行Lipo2000轉(zhuǎn)染,結(jié)果顯示有干擾效果,是否可說(shuō)明insert制備沒(méi)問(wèn)題? 對(duì)照組a與實(shí)驗(yàn)組長(zhǎng)出菌落數(shù)量接近,是否可以得出酶切不成功,長(zhǎng)出的都是假陽(yáng)性呢? Bgl Ⅱ和Hind Ⅲ相差6bp,可以用瓊脂糖電泳能鑒別出來(lái)嗎?有什么方法可以在轉(zhuǎn)化前就確定質(zhì)粒酶切成功呢? 感謝前輩的支持 此致 敬禮 |
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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沒(méi)加insert的載體有自連,并且比實(shí)驗(yàn)組還多,說(shuō)明載體酶切不完全。實(shí)際上任何酶切反應(yīng)都有完成程度問(wèn)題,不會(huì)是100%。對(duì)照C比A菌落少是因?yàn)榧恿薼igase之后,線性載體換化,轉(zhuǎn)化效率提高。加入insert后,在連接酶的作用下,可能有一端連上了insert, 而另外一端不匹配,所以insert干擾載體的自連。 相差6bp瓊脂糖電泳是不能看出來(lái)的。判斷酶切是否成功可以在做雙酶切的同時(shí)分別做兩個(gè)單酶切的對(duì)照實(shí)驗(yàn)。然后跑電泳檢測(cè)。質(zhì)粒被單酶切開后從超螺旋結(jié)構(gòu)變成線性,很容易從膠上判斷。 你的實(shí)驗(yàn)組沒(méi)有多少克隆,可以做菌落PCR篩一下。不過(guò)我個(gè)人認(rèn)為你的菌落數(shù)很少,比對(duì)照組a還少,是陽(yáng)性克隆的概率不大。 |
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