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Ever希夷新蟲 (初入文壇)
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請問大片段怎么擴 已有9人參與
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| 構(gòu)建好了質(zhì)粒,但是目的片段將近8000bp,這種大片段用LA taq酶一直擴不出來,請問怎么辦? |
核酸生物學(xué)實驗經(jīng)驗 | Vectors contribution |
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長片段PC不同于一般PCR的特殊要求: 1.用Taq-LA DNA聚合酶,該酶是Taq酶或Klentaq 1(無糾錯功能)與pfu酶或Deep Vent酶(有糾錯功能)的混合物,以Taq酶為主。 2.當(dāng)需要擴增的片段大于20kd時,需要加入高濃度的甜茶堿(終濃度為1.5-2.0mol/L),提高PCR的效率,但是甜茶堿加入后,要將擴增反應(yīng)的溫度降低2-3度。樓主的擴增片段還到不了2020kd,甜茶堿可以少加點。 3.適當(dāng)升高鎂離子濃度,不要太高了鎂離子濃度高于底物dNTP濃度即可。 4.變性時間要短,尤其是一般不超過30 s,尤其是模板長度超過8KD時更是如此,變性時間長會破壞模板。 5.延伸溫度可以下降為68攝氏度,同時加長延伸反應(yīng)時間,長度為3-5kd的模板延伸反應(yīng)時間為5-10分鐘,長度為20-35kd的模板延伸反應(yīng)時間為20分鐘,樓主的PCR的延伸反應(yīng)時間可能為12-16分鐘左右。 6.模板濃度最好在1ng/L以內(nèi)。 7.應(yīng)用長片段PCR緩沖溶液。10X長片段PCR緩沖溶液組成為:500 mmol/L Tris-Cl(pH=9.0),160 mmol/L硫酸銨,25 mmol/L MgCl2,1.5mmol/L BSA。 8.設(shè)計較長的PCR引物(25-30 bp) |
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