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(木蟲生物專題討論)之核酸提取純化專題貼
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———————————————————————————————— 繼續(xù)招帖子工,招聘鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=910794&fpage=1 ——————————————————————————————————— 不才經(jīng)過半個(gè)多月的整理,核酸提取純化專題終于完成了。 本專題共分兩篇 一為技巧篇 二為解惑篇 其中每篇分別整理成三章: DNA,RNA(含mRNA)和質(zhì)粒。 請各位多多支持! 如果你覺得你從中學(xué)到了一點(diǎn)東西, 就把它頂起來吧, 讓更多的人從中獲益~ ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() [ Last edited by raindrop8316 on 2008-8-19 at 08:44 ] |
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第一章 DNA提取與純化 主題16:植物線粒體DNA的提取 鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=569136&fpage=206 無解答 主題17:CTAB法提DNA出現(xiàn)問題(碎末狀沉淀) 鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=578068&fpage=195 解答1:guohuayin 我覺得碎末狀沉淀是你沒有去除干凈的蛋白質(zhì),在苯酚-氯仿重提階段,建議不要為了獲取大量的的DNA而將中間的那層吸出來,那層是蛋白質(zhì),吸取上清液的時(shí)候,在最后快要吸完的時(shí)候,最好不要繼續(xù)吸出了,防止蛋白質(zhì)污染。建議你用苯酚-氯仿抽提一次,再用氯仿:異戊醇抽提一次。并且用70%的酒精多洗滌幾次,酒精洗滌的作用主要是去除鹽分。最后酒精洗滌完后,一定要晾干后再用適量的雙蒸水溶解或者TE緩沖液溶解。 解答2:沙礫 建議大家在做DNA沉淀的時(shí)候加入1/10體積的3M的醋酸鈉,再加無水乙醇,沉淀效果會(huì)更好 主題18:提取DNA檢測發(fā)現(xiàn)三條帶,誰能解釋? 鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=584447&fpage=195 解答1:tuotuozw 材料,過程都有可能造成DNA的怪異現(xiàn)象出現(xiàn) 解答2:xuuue 可能是連同RNA一起提了出來,這很正常,你去RNA了嗎? 解答3:如果泳道沒有明顯彌散現(xiàn)象,而且LZ電泳中出現(xiàn)的3條帶中的2條挨得很進(jìn),且與第3條距離較遠(yuǎn)的話,那多數(shù)應(yīng)該是xuuue所說的提取樣品中混有RNA,加點(diǎn)RNaseA處理一下就可以了。 主題19:核酸提取求助:幫忙分析下失敗原因在哪? 鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=593897&fpage=188 解答1:guohuayin 抽提核酸中我的做法是 首先加入等體積的苯酚:氯仿:異戊醇(體積比25:24:1),輕輕上下顛倒幾次,混勻2分鐘左右,12000rpm,離心10分鐘; 然后吸取上清液,加入等體積的氯仿:異戊醇(體積比24:1)和上面的步驟一樣,抽提一次,取上清 這兩步試驗(yàn)可以反復(fù)三次,主要是去除蛋白質(zhì)和糖類等雜質(zhì)。 最后加入1/10體積的3M的醋酸鈉(.PH5.3),2倍體積的無水乙醇沉淀DNA。 -20度放置30分鐘,室溫15000rpm,離心10分鐘,沉淀用70%的乙醇洗滌去除鹽分,稍微干燥后,加入適量的緩沖液溶解。-20度冰箱中保存。 解答2:yangguoxing888 應(yīng)該和上下顛倒的時(shí)間沒關(guān)系。沒準(zhǔn)是你基因組提取后溶解,如果緩沖液多得話DNA濃度會(huì)低,這樣也不一定能跑出來,至于前端的東西,沒準(zhǔn)是RNA。 解答3:tsguest 你上下顛倒混勻的時(shí)間太長了,這樣容易把DNA弄斷,而且如果你要是需要大片段的DNA,這樣做更是不行。你如果把DNA一提出來,馬上就跑,有可能就什么也跑不出來,你可以用TE溶了DNA后,在4度放置一晚,第二天再跑電泳就有可能有你提的DNA, 解答4:yzh-1999 說太劇烈導(dǎo)致鏈斷裂,最后使得溶液渾濁這個(gè)說法太牽強(qiáng)。 我還是同意樓主說的,是消化不徹底的問題。我抽提RNA時(shí),若樣本太多,導(dǎo)致Trizol不夠用的時(shí)候,也會(huì)出現(xiàn)大量的渾濁。我想可能是你沒有加蛋白酶K,或量太少,導(dǎo)致蛋白消化不徹底,所以后續(xù)加酚不能使它沉淀分層。 冷凍后,這些懸在溶液中的蛋白析出,很正常。 所以,從消化開始,再注意點(diǎn)。 解答5:insect2004 你用的EB染色是不是濃度太低,或用的時(shí)間太長,把EB換成新的,另外加上MARK, 這樣如果MARK跑出來而你的DNA沒有跑出來,那就說明不是染色的問題,你再找別的原因,如果你不是用試劑盒提得,那你就檢查一下你的關(guān)鍵試劑有沒有問題,原因得一步步找,實(shí)驗(yàn)做得多了,你的經(jīng)驗(yàn)也就多了,你再多提幾次 解答6:yzh-1999 前面那些彌散條帶可能是RNA,降解的DNA等等。 建議重新配制和準(zhǔn)備試劑, 消化時(shí)間長一些,比如甚至可以將正在消化的樣品在37度的搖床上過夜 解答6:insect2004 把樣品保存在-80度,保存1-2年不會(huì)有問題,如果你們實(shí)驗(yàn)室沒有超低溫冰箱,那你就把樣品保存在-20度,保存一兩個(gè)月應(yīng)該沒有問題。關(guān)鍵試劑重新配,也不費(fèi)多少事 主題20:求助DNA提。 鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=597267&fpage=187 解答1:guohuayin 首先你先檢測一下你的有沒有提取出DNA,這個(gè)問題你可以先測定吸光度,同時(shí)也可以測定一下純度,確定提取出來DNA后,再進(jìn)行PCR擴(kuò)增目的基因。擴(kuò)增的時(shí)間一定要加入對照,看看PCR體系有沒有問題。 解答2:自然風(fēng) 你的試劑盒加酶之后處理的時(shí)間是不是比較短?因?yàn)樵噭┖信c常規(guī)提DNA的方法的差別之一就是試劑盒酶處理的時(shí)間要短得多,可能有這方面的原因。 另外,你的試劑盒是否是用柱子回收的?可以試試用常規(guī)的酚氯仿代替柱子回收看看,因?yàn)閷τ诖笃蔚腄NA,用柱子回收效果稍差。 還有,是不是因?yàn)闃悠返牧勘容^少,才導(dǎo)致檢測不清楚? 解答3:bioartist 提取總DNA,破胞很關(guān)鍵! 上海生工的試劑盒都是用于一般菌體的提取,對胞外多糖多的細(xì)菌和革蘭氏陽性菌,一般都比較難提。 另外,有時(shí)候,試劑盒提取的DNA量非常少,電泳檢測不到,但可以用于PCR擴(kuò)增目的基因,其他操作不宜! 其實(shí)許多傳統(tǒng)的方法提取效果都很好的!! 解答4:xiaopu_yin 你抽提的是細(xì)菌、放線菌還是酵母?我用的是博達(dá)泰克的試劑盒,一般用液氮或在-80度反復(fù)凍融幾次就會(huì)有較好的效果。總之破胞很重要,而菌體量過多有時(shí)效果反而不好。 |
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